RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 ECE2O60344 883 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 RGMBQ6NW40 437 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 RTL9Q8NET4 1388 aa15.29■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 RPS12P25398 132 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 C2orf69Q8N8R5 385 aa15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 EYA3Q99504 573 aa15.28■□□□□ 0.04
RABGEF1-207ENST00000484547 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.27■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 TBC1D16Q8TBP0 767 aa15.27■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 RPS8P62241 208 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC102AQ96A19 550 aa15.26■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 GGA3Q9NZ52 723 aa15.26■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.26■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 RALBP1Q15311 655 aa15.25■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 SULF1Q8IWU6 871 aa15.25■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 PSME4Q14997 1843 aa15.25■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 G3V3G9 751 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 TRPA1O75762 1119 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 HOXB7P09629 217 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 HYPKQ9NX55 129 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 RNF186Q9NXI6 227 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 SAGE1Q9NXZ1 904 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 UFL1O94874 794 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 VIL1P09327 827 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 CDCA5Q96FF9 252 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa15.24■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC10A3P09131 477 aa15.23■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.23■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 RUNDC1Q96C34 613 aa15.23■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 SOX10P56693 466 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 GGA1Q9UJY5 639 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 GOLGA2Q08379 1002 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 SCARF1Q14162 830 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 CSRNP1Q96S65 589 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 MYD88Q99836 296 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 MBIPQ9NS73 344 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 SPEF2Q9C093 1822 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC152Q4G0S7 254 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 RASAL3Q86YV0 1011 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 AGBL3Q8NEM8 1001 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 MYH3P11055 1940 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 XDHP47989 1333 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF609O15014 1411 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 PDE8AO60658 829 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 USP17L8P0C7I0 530 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 MOB2Q70IA6 237 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 CCER2I3L3R5 266 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 GMLQ99445 158 aa15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 USP17L3A6NCW0 530 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 USP17L4A6NCW7 530 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 FKBP1BP68106 108 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF853P0CG23 659 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ATP2B4P23634 1241 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 PODNQ7Z5L7 613 aa15.14■□□□□ 0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 MXD3Q9BW11 206 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms