RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 FUCA2Q9BTY2 467 aa19■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 SMC2O95347 1197 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 RAD50Q92878 1312 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 CHGBP05060 677 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 GPATCH3Q96I76 525 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 HYPKQ9NX55 129 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 EPHA10Q5JZY3 1008 aa18.99■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 ERBB3P21860 1342 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 NR1I2O75469 434 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 UBXN4Q92575 508 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 TCHHQ07283 1943 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM87AQ8NBN3 555 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 LINS1Q8NG48 757 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 SASH1O94885 1247 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV5-2P06315 115 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 TMCO3Q6UWJ1 677 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 ERO1AQ96HE7 468 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC34Q96HJ3 373 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 HOXB7P09629 217 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 CAPN2P17655 700 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 KAZALD1Q96I82 304 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC8AQ8IWT6 810 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 KRBA2Q6ZNG9 492 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 C19orf44Q9H6X5 657 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 RSPH14Q9UHP6 348 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 NRDCO43847 1150 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 URI1O94763 535 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC171Q6TFL3 1326 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 ALDH1L1O75891 902 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 CABP4P57796 275 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 ME3Q16798 604 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 PDIA6Q15084 440 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 NPHP3Q7Z494 1330 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 CHMP4CQ96CF2 233 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 TOMM22Q9NS69 142 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 DNAI1Q9UI46 699 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 NFAT5O94916 1531 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 PHKG2P15735 406 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 SDF4Q9BRK5 362 aa18.94■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 GYS2P54840 703 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 GPS2Q13227 327 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 STRN4Q9NRL3 753 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC191Q8NCU4 936 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087WZG4 1122 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0D9SFI3 127 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0G2JS52 829 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 EPC1Q9H2F5 836 aa18.93■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 NEURL1BA8MQ27 555 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 LMAN1P49257 510 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 SLFNL1Q499Z3 407 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 CYP27B1O15528 508 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 CLCN6P51797 869 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 SYCP1Q15431 976 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 ISM2Q6H9L7 571 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 IFNL2Q8IZJ0 200 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 LRRN4CLQ8ND94 238 aa18.92■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 BIN1O00499 593 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 PDCP20941 246 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 GCKRQ14397 625 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 ERC1Q8IUD2 1116 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 AOX1Q06278 1338 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 TMC6Q7Z403 805 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 AOPEPQ8N6M6 819 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 TPM4P67936 248 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 TFCP2Q12800 502 aa18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 KINO60870 393 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 EVI5LQ96CN4 794 aa18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms