RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 EXOC5O00471 708 aa5.66□□□□□ -1.5
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SHQ1-208ENST00000482785 RGS20O76081 388 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-208ENST00000482785 ERCC3P19447 782 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-208ENST00000482785 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-208ENST00000482785 WAPLQ7Z5K2 1190 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-208ENST00000482785 SLF2Q8IX21 1173 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-208ENST00000482785 RABGEF1Q9UJ41 708 aa5.66□□□□□ -1.5
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SHQ1-208ENST00000482785 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
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SHQ1-208ENST00000482785 USP17L4A6NCW7 530 aa5.58□□□□□ -1.52
SHQ1-208ENST00000482785 CFHP08603 1231 aa5.58□□□□□ -1.52
SHQ1-208ENST00000482785 SSFA2P28290 1259 aa5.58□□□□□ -1.52
SHQ1-208ENST00000482785 EPHX2P34913 555 aa5.58□□□□□ -1.52
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