RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 RIMBP2O15034 1052 aa9.63□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 ECE2O60344 883 aa9.63□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 DOK7Q18PE1 504 aa9.63□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 TMC4Q7Z404 712 aa9.63□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 ARMC5Q96C12 935 aa9.63□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 TRIM17Q9Y577 477 aa9.63□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF609O15014 1411 aa9.63□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa9.62□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 COL4A1P02462 1669 aa9.62□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 SREBF2Q12772 1141 aa9.62□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.62□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 PTPN22Q9Y2R2 807 aa9.62□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.62□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 GPSM2P81274 684 aa9.61□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 PDIA6Q15084 440 aa9.61□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa9.61□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 NLRP10Q86W26 655 aa9.61□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 GMLQ99445 158 aa9.61□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 ERBB4Q15303 1308 aa9.6□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 H0YGN5 161 aa9.6□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 CAP1Q01518 475 aa9.6□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 AGBL3Q8NEM8 1001 aa9.6□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.6□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 NECTIN2Q92692 538 aa9.6□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 PSME4Q14997 1843 aa9.59□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 C6orf229H3BNL8 230 aa9.59□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 ALDH1A1P00352 501 aa9.59□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 SPRYD7Q5W111 196 aa9.59□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 EYA3Q99504 573 aa9.59□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.59□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.59□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 PROSER3Q2NL68 480 aa9.58□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.58□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.58□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 IFNL1Q8IU54 200 aa9.58□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF333Q96JL9 665 aa9.58□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 PRO3102Q9H379 93 aa9.58□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.58□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 LAMB1P07942 1786 aa9.58□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.57□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 USP17L8P0C7I0 530 aa9.57□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 TCIRG1Q13488 830 aa9.57□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.57□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.57□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.57□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 ERO1AQ96HE7 468 aa9.57□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 ANXA1P04083 346 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 INHBEP58166 350 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 EFCC1Q9HA90 598 aa9.56□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 VCANP13611 3396 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 WNT10BO00744 389 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 COPS6Q7L5N1 327 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.55□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 NF2P35240 595 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 RPS8P62241 208 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 CRHR2Q13324 411 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 MAP3K11Q16584 847 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF428Q96B54 188 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 FZD1Q9UP38 647 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 NUDCQ9Y266 331 aa9.54□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 USP17L3A6NCW0 530 aa9.53□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 USP17L4A6NCW7 530 aa9.53□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 UFL1O94874 794 aa9.53□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 SP3Q02447 781 aa9.53□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 PRKG1Q13976 671 aa9.53□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.53□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.53□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 FAM89AQ96GI7 184 aa9.53□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 WNK4Q96J92 1243 aa9.53□□□□□ -0.88
CASQ1-203ENST00000481081 PTPN18Q99952 460 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms