RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.16■■■□□ 2.1
RBMS1-211ENST00000477486 TRAF5O00463 557 aa28.15■■■□□ 2.1
RBMS1-211ENST00000477486 PSMD14O00487 310 aa28.15■■■□□ 2.1
RBMS1-211ENST00000477486 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
RBMS1-211ENST00000477486 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
RBMS1-211ENST00000477486 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.14■■■□□ 2.1
RBMS1-211ENST00000477486 CTSWP56202 376 aa28.14■■■□□ 2.1
RBMS1-211ENST00000477486 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
RBMS1-211ENST00000477486 FLIIQ13045 1269 aa28.14■■■□□ 2.1
RBMS1-211ENST00000477486 MICALL2Q8IY33 904 aa28.14■■■□□ 2.1
RBMS1-211ENST00000477486 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
RBMS1-211ENST00000477486 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.14■■■□□ 2.1
RBMS1-211ENST00000477486 COL4A1P02462 1669 aa28.13■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.13■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 VAMP4O75379 141 aa28.12■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 AIDAQ96BJ3 306 aa28.12■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 KCNQ5Q9NR82 932 aa28.12■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 SHTN1A0MZ66 631 aa28.11■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 RASSF10A6NK89 507 aa28.11■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.11■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 DPF2Q92785 391 aa28.11■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 TNS4Q8IZW8 715 aa28.1■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 TRPM4Q8TD43 1214 aa28.1■■■□□ 2.09
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RBMS1-211ENST00000477486 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.1■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.1■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 H7C1W4 665 aa28.09■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
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RBMS1-211ENST00000477486 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
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RBMS1-211ENST00000477486 CST9Q5W186 159 aa28.08■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.08■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 ZNF408Q9H9D4 720 aa28.08■■■□□ 2.09
RBMS1-211ENST00000477486 CELF2O95319 508 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
RBMS1-211ENST00000477486 ATP2B4P23634 1241 aa28.07■■■□□ 2.08
RBMS1-211ENST00000477486 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
RBMS1-211ENST00000477486 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.07■■■□□ 2.08
RBMS1-211ENST00000477486 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.07■■■□□ 2.08
RBMS1-211ENST00000477486 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
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RBMS1-211ENST00000477486 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
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RBMS1-211ENST00000477486 USP48Q86UV5 1035 aa28.04■■■□□ 2.08
RBMS1-211ENST00000477486 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
RBMS1-211ENST00000477486 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.04■■■□□ 2.08
RBMS1-211ENST00000477486 PCNTO95613 3336 aa28.04■■■□□ 2.08
RBMS1-211ENST00000477486 TRPM7Q96QT4 1865 aa28.04■■■□□ 2.08
RBMS1-211ENST00000477486 FOXN1O15353 648 aa28.03■■■□□ 2.08
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RBMS1-211ENST00000477486 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
RBMS1-211ENST00000477486 CYP4F22Q6NT55 531 aa28.01■■■□□ 2.07
RBMS1-211ENST00000477486 CAPN15O75808 1086 aa28■■■□□ 2.07
RBMS1-211ENST00000477486 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
RBMS1-211ENST00000477486 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28■■■□□ 2.07
RBMS1-211ENST00000477486 WBP1LQ9NX94 342 aa28■■■□□ 2.07
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RBMS1-211ENST00000477486 KRT26Q7Z3Y9 468 aa27.99■■■□□ 2.07
RBMS1-211ENST00000477486 PODNQ7Z5L7 613 aa27.99■■■□□ 2.07
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RBMS1-211ENST00000477486 KCNJ4P48050 445 aa27.95■■■□□ 2.06
RBMS1-211ENST00000477486 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.95■■■□□ 2.06
RBMS1-211ENST00000477486 DLK2Q6UY11 383 aa27.95■■■□□ 2.06
RBMS1-211ENST00000477486 LBX1P52954 281 aa27.94■■■□□ 2.06
RBMS1-211ENST00000477486 BEND3Q5T5X7 828 aa27.94■■■□□ 2.06
RBMS1-211ENST00000477486 SULF1Q8IWU6 871 aa27.94■■■□□ 2.06
RBMS1-211ENST00000477486 USP17L8P0C7I0 530 aa27.93■■■□□ 2.06
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