RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC10A3P09131 477 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 HLFQ16534 295 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 RIC3Q7Z5B4 369 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 USP48Q86UV5 1035 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 LARGE2Q8N3Y3 721 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa13.63□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 NUP98P52948 1817 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 ABCC12Q96J65 1359 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 CXCL9Q07325 125 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 CDC37L1Q7L3B6 337 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 DNAAF4Q8WXU2 420 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF652Q9Y2D9 606 aa13.62□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 F6X3S4 739 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 TBC1D8O95759 1140 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 TCIRG1Q13488 830 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa13.61□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 ADM5C9JUS6 153 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 EGFRP00533 1210 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 TRIM27P14373 513 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 AOC3Q16853 763 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF34Q8IZ26 560 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 OTUD5Q96G74 571 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 UNC80Q8N2C7 3258 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM177BA6PVY3 158 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 PLIN1O60240 522 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 RASAL3Q86YV0 1011 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 NIM1KQ8IY84 436 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC102AQ96A19 550 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 MYD88Q99836 296 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 ISCA1Q9BUE6 129 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 HDAC9Q9UKV0 1011 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP1-207ENST00000471650 NEXNQ0ZGT2 675 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 BEND3Q5T5X7 828 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC4A10Q6U841 1118 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 TNNQ9UQP3 1299 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 ABCC4O15439 1325 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 IGKV5-2P06315 115 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 MS4A1P11836 297 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 RRP1P56182 461 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 CRY2Q49AN0 593 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 LINS1Q8NG48 757 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 NEURL1BA8MQ27 555 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 PPIP5K2O43314 1243 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 ALDH1L1O75891 902 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 GPTP24298 496 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 ALDH1B1P30837 517 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 CCT4P50991 539 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 PARP10Q53GL7 1025 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 NLRP10Q86W26 655 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC191Q8NCU4 936 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 CLUAP1Q96AJ1 413 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 UBN2Q6ZU65 1347 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 RIC1Q4ADV7 1423 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 RAD17O75943 681 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 RLBP1P12271 317 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 PDE3AQ14432 1141 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 SUSD4Q5VX71 490 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 SAMD7Q7Z3H4 446 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 H0YGN5 161 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 GPR25O00155 361 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 GCKRQ14397 625 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 KRT26Q7Z3Y9 468 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM57Q8N5G2 664 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 C2orf69Q8N8R5 385 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 PANK1Q8TE04 598 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 LAMA3Q16787 3333 aa13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SH3BP1-207ENST00000471650 YDJCA8MPS7 323 aa13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms