RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471582.5

COL20A1-205, Transcript of collagen type XX alpha 1 chain, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene COL20A1, Length 1,924 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1-205ENST00000471582 ATRNO75882 1429 aa22.22■■□□□ 1.15
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COL20A1-205ENST00000471582 SYT1P21579 422 aa22.22■■□□□ 1.15
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COL20A1-205ENST00000471582 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.21■■□□□ 1.15
COL20A1-205ENST00000471582 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.21■■□□□ 1.15
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COL20A1-205ENST00000471582 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.2■■□□□ 1.14
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COL20A1-205ENST00000471582 GOLIM4O00461 696 aa22.19■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 ST3GAL1Q11201 340 aa22.19■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 F13A1P00488 732 aa22.18■■□□□ 1.14
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COL20A1-205ENST00000471582 NLRP10Q86W26 655 aa22.18■■□□□ 1.14
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COL20A1-205ENST00000471582 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.18■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.17■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.17■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.17■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.17■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.16■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
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COL20A1-205ENST00000471582 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.16■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.16■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 NEK1Q96PY6 1258 aa22.16■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 MYH3P11055 1940 aa22.15■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 HLFQ16534 295 aa22.15■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.15■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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COL20A1-205ENST00000471582 CYP21A2P08686 494 aa22.14■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 PDCP20941 246 aa22.14■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 ATP6V1AP38606 617 aa22.14■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.14■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 USP48Q86UV5 1035 aa22.14■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 NUP98P52948 1817 aa22.14■■□□□ 1.14
COL20A1-205ENST00000471582 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.14■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.14■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 SIK1P57059 783 aa22.14■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 CHGBP05060 677 aa22.13■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.13■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 NECAB1Q8N987 351 aa22.13■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 KCNQ2O43526 872 aa22.12■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 CTSWP56202 376 aa22.12■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.12■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.12■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 XAGE2Q96GT9 111 aa22.12■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.12■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.12■■□□□ 1.13
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COL20A1-205ENST00000471582 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 TCHHQ07283 1943 aa22.11■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 MAST3O60307 1309 aa22.11■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 PHF14O94880 888 aa22.11■■□□□ 1.13
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COL20A1-205ENST00000471582 GORABQ5T7V8 394 aa22.11■■□□□ 1.13
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COL20A1-205ENST00000471582 RREB1Q92766 1687 aa22.1■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.1■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.1■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.1■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.1■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 LRP5O75197 1615 aa22.1■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.1■■□□□ 1.13
COL20A1-205ENST00000471582 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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