RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466861.1

SUMO3-205, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 753 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-205	ENST00000466861	EYA3	Q99504	573 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	PPIP5K2	O43314	1243 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	ATP2B4	P23634	1241 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	GGA1	Q9UJY5	639 aa		29.22	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	FZD9	O00144	591 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	MEIS3	Q99687	375 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	TNN	Q9UQP3	1299 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SUMO3-205	ENST00000466861	NIM1K	Q8IY84	436 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	POLL	Q9UGP5	575 aa		29.2	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	C6orf229	H3BNL8	230 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	WASHC4	Q2M389	1173 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		29.19	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	AOC3	Q16853	763 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	UFL1	O94874	794 aa		29.17	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	COL4A5	P29400	1685 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	GNAI2	P04899	355 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	RLBP1	P12271	317 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	WDR90	Q96KV7	1748 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	CHRND	Q07001	517 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	MTX1	Q13505	466 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	FBXO3	Q9UK99	471 aa		29.14	■■■□□ 2.26
SUMO3-205	ENST00000466861	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861		A0A1B0GUL6	1792 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	MED23	Q9ULK4	1368 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	PDE3A	Q14432	1141 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	GPC2	Q8N158	579 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	SCN4A	P35499	1836 aa		29.09	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	PANK1	Q8TE04	598 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SUMO3-205	ENST00000466861	RIMBP2	O15034	1052 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	KCNJ4	P48050	445 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	TNIP1	Q15025	636 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	EYA2	O00167	538 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	KIF3C	O14782	793 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	CIAO1	O76071	339 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	COPRS	Q9NQ92	184 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861		G3V3G9	751 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	ECE2	O60344	883 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	CXCL9	Q07325	125 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	UBE4A	Q14139	1066 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	PODN	Q7Z5L7	613 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	RRAGC	Q9HB90	399 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	COA1	Q9GZY4	146 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	YDJC	A8MPS7	323 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	SRGAP3	O43295	1099 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	PLIN1	O60240	522 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	PSME4	Q14997	1843 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	TAF5L	O75529	589 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	LRRC24	Q50LG9	513 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
SUMO3-205	ENST00000466861	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	POTEC	B2RU33	542 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	PDE8B	O95263	885 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	DOK7	Q18PE1	504 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	METTL24	Q5JXM2	366 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		29.01	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		29	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	SCN9A	Q15858	1988 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	ATP8B2	P98198	1209 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
SUMO3-205	ENST00000466861	COG6	Q9Y2V7	657 aa		28.99	■■■□□ 2.23

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