RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466579.1

SDCCAG3-208, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, human

TSL 1 (best)

Gene SDCCAG3, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDCCAG3-208	ENST00000466579	XDH	P47989	1333 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KIF3C	O14782	793 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PPIP5K2	O43314	1243 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TNN	Q9UQP3	1299 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SCN4A	P35499	1836 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	POTEC	B2RU33	542 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	AOC3	Q16853	763 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EYA3	Q99504	573 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GNAI3	P08754	354 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NIM1K	Q8IY84	436 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GPC2	Q8N158	579 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MEIS3	Q99687	375 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PSME4	Q14997	1843 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SDCCAG3-208	ENST00000466579	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	UFL1	O94874	794 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RLBP1	P12271	317 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CHRND	Q07001	517 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MTX1	Q13505	466 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF609	O15014	1411 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	YDJC	A8MPS7	323 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CXCL9	Q07325	125 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RRAGC	Q9HB90	399 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MS4A1	P11836	297 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ECE2	O60344	883 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TOMM70	O94826	608 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GNAI2	P04899	355 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SCNN1D	P51172	638 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TNIP1	Q15025	636 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EYA2	O00167	538 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TAF5L	O75529	589 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CIAO1	O76071	339 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PDE3A	Q14432	1141 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PANK1	Q8TE04	598 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SDCCAG3-208	ENST00000466579	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.84	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.5 ms