RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, human

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL1-208	ENST00000466278	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	XDH	P47989	1333 aa		28.99	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	BEND3	Q5T5X7	828 aa		28.99	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		28.99	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	CREBZF	Q9NS37	354 aa		28.99	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		28.98	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	ECE2	O60344	883 aa		28.97	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	SLFN5	Q08AF3	891 aa		28.96	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	CNTROB	Q8N137	903 aa		28.96	■■■□□ 2.23
MKL1-208	ENST00000466278	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	FAM161A	Q3B820	660 aa		28.95	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	JMY	Q8N9B5	988 aa		28.95	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	CSF1R	P07333	972 aa		28.94	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	ITGA6	P23229	1130 aa		28.94	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	ATP2B4	P23634	1241 aa		28.94	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	DOK7	Q18PE1	504 aa		28.94	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278		G3V3G9	751 aa		28.93	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	PSMD14	O00487	310 aa		28.93	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		28.93	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		28.93	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	SCN9A	Q15858	1988 aa		28.93	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	ALDH1L1	O75891	902 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	GRM8	O00222	908 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	PSME4	Q14997	1843 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	DPF2	Q92785	391 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	MED23	Q9ULK4	1368 aa		28.89	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	MICALL2	Q8IY33	904 aa		28.89	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		28.89	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
MKL1-208	ENST00000466278	PTPRC	P08575	1304 aa		28.89	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		28.88	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278		H7C1D1	291 aa		28.88	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	FOXO4	P98177	505 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	PCNT	O95613	3336 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	CNTNAP1	P78357	1384 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF609	O15014	1411 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	SHTN1	A0MZ66	631 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	PODN	Q7Z5L7	613 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MKL1-208	ENST00000466278	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278		A0A1B0GUL6	1792 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	CHRND	Q07001	517 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	UTY	O14607	1347 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	TRAF5	O00463	557 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	COA1	Q9GZY4	146 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	USP17L3	A6NCW0	530 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	USP17L4	A6NCW7	530 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	KCNJ4	P48050	445 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	SUCLG2	Q96I99	432 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	28.77	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	RASSF10	A6NK89	507 aa		28.76	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		28.76	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		28.76	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	EGFR	P00533	1210 aa		28.75	■■■□□ 2.19

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