RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 FBXO11Q86XK2 927 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 OR13H1Q8NG92 308 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 USP21Q9UK80 565 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 SCNN1AP37088 669 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 HELQQ8TDG4 1101 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 ATCAYQ86WG3 371 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 ITGB7P26010 798 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 HYAL2Q12891 473 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 SSFA2P28290 1259 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 DYRK3O43781 588 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 EDEM1Q92611 657 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 SPACA7Q96KW9 195 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP11AP98196 1134 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 ELP3Q9H9T3 547 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 MPSTP25325 297 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 DLL1O00548 723 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 KIF4AO95239 1232 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 PCSK2P16519 638 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 CEP135Q66GS9 1140 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 TP53INP1Q96A56 240 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 CARNS1A5YM72 827 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 PDGFAP04085 211 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 MTMR3Q13615 1198 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.071e-14■■■■□ 25.2
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RABGGTB-204ENST00000461653 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.37□□□□□ -1.07
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RABGGTB-204ENST00000461653 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 SETDB1Q15047 1291 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 MUC3BQ9H195 1237 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 PPME1Q9Y570 386 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 C8orf34Q49A92 452 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 XKR5Q6UX68 686 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 TTC16Q8NEE8 873 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 CNTN3Q9P232 1028 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 MTMR7Q9Y216 660 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 A6NHS1 94 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 Q8N3U1 123 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 CEP120Q8N960 986 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC01387J3KSC0 135 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 PBX4Q9BYU1 374 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 CDC27P30260 824 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 AAMPQ13685 434 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 XP32Q5T750 250 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 POLIQ9UNA4 740 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM177BA6PVY3 158 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 NPR3P17342 541 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 CES1P23141 567 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 F8W735 103 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM13AO94988 1023 aa8.32□□□□□ -1.08
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