RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461225.5

PLXDC1-207, Transcript of plexin domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PLXDC1, Length 2,726 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC1-207ENST00000461225 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 A0A087WZG4 1122 aa14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 NECTIN1Q15223 517 aa14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 KDM4AO75164 1064 aa14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.99□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 COL18A1P39060 1754 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 SYT1P21579 422 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 ST3GAL1Q11201 340 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 HOMEZQ8IX15 550 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 NBPF26B4DH59 902 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 NBPF14Q5TI25 921 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 NBPF15Q8N660 670 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 ZBTB9Q96C00 473 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.98□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.97□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 SLC27A2O14975 620 aa14.97□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.97□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 ME3Q16798 604 aa14.97□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.97□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.97□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.97□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 STX6O43752 255 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 A1BGP04217 495 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 GJB2P29033 226 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 TNNI3KQ59H18 835 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 MAP4K1Q92918 833 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 ICE2Q659A1 982 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 KCNB2Q92953 911 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 COPRSQ9NQ92 184 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.96□□□□□ -0.01
PLXDC1-207ENST00000461225 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.95□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 VPS53Q5VIR6 699 aa14.95□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 BRINP3Q76B58 766 aa14.95□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.95□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 CASP7P55210 303 aa14.94□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.94□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 FIBPO43427 364 aa14.94□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.94□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 F13A1P00488 732 aa14.94□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 COL15A1P39059 1388 aa14.93□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 HIP1O00291 1037 aa14.93□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.93□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 STRN4Q9NRL3 753 aa14.93□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 MRC1P22897 1456 aa14.93□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.93□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.93□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 CASQ1P31415 396 aa14.92□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 FOXO4P98177 505 aa14.92□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 STK3Q13188 491 aa14.92□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 MTMR6Q9Y217 621 aa14.92□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 MED23Q9ULK4 1368 aa14.92□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 TAF5LO75529 589 aa14.92□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 ATP5JP18859 108 aa14.92□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.92□□□□□ -0.02
PLXDC1-207ENST00000461225 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms