RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
ABCD4-202ENST00000460308 RRAGCQ9HB90 399 aa26.91■■□□□ 1.9
ABCD4-202ENST00000460308 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.91■■□□□ 1.9
ABCD4-202ENST00000460308 POLLQ9UGP5 575 aa26.91■■□□□ 1.9
ABCD4-202ENST00000460308 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.91■■□□□ 1.9
ABCD4-202ENST00000460308 XDHP47989 1333 aa26.9■■□□□ 1.9
ABCD4-202ENST00000460308 UFL1O94874 794 aa26.9■■□□□ 1.9
ABCD4-202ENST00000460308 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
ABCD4-202ENST00000460308 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.9■■□□□ 1.9
ABCD4-202ENST00000460308 SPEF2Q9C093 1822 aa26.9■■□□□ 1.9
ABCD4-202ENST00000460308 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
ABCD4-202ENST00000460308 RIMBP2O15034 1052 aa26.88■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 ATP2B4P23634 1241 aa26.88■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.88■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 TNNQ9UQP3 1299 aa26.88■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.87■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.87■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 G3V3G9 751 aa26.86■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.86■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.86■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 KIF3CO14782 793 aa26.85■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 GNAI3P08754 354 aa26.85■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.85■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.85■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.85■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.85■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.84■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 GPC2Q8N158 579 aa26.84■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 MEIS3Q99687 375 aa26.84■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 COL4A5P29400 1685 aa26.83■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 CHRNDQ07001 517 aa26.83■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.83■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.83■■□□□ 1.89
ABCD4-202ENST00000460308 LTBP1Q14766 1721 aa26.82■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 KCNJ4P48050 445 aa26.82■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.82■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 DOK7Q18PE1 504 aa26.81■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.8■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 MS4A1P11836 297 aa26.8■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 WDR90Q96KV7 1748 aa26.79■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 CXCL9Q07325 125 aa26.79■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 TNIP1Q15025 636 aa26.79■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.79■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.79■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 PLIN1O60240 522 aa26.78■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 ECE2O60344 883 aa26.78■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 RAD17O75943 681 aa26.78■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 TOMM70O94826 608 aa26.78■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.78■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 YDJCA8MPS7 323 aa26.77■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 POTECB2RU33 542 aa26.77■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 TAF5LO75529 589 aa26.77■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 C1QTNF8P60827 252 aa26.77■■□□□ 1.88
ABCD4-202ENST00000460308 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 GNAI2P04899 355 aa26.76■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 HACL1Q9UJ83 578 aa26.76■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 MED23Q9ULK4 1368 aa26.75■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 RLBP1P12271 317 aa26.75■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.74■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.74■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.74■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 PANK1Q8TE04 598 aa26.73■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 SCN4AP35499 1836 aa26.73■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 LRRC24Q50LG9 513 aa26.72■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 METTL24Q5JXM2 366 aa26.72■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 PODNQ7Z5L7 613 aa26.72■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 COA1Q9GZY4 146 aa26.71■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
ABCD4-202ENST00000460308 SNAP23O00161 211 aa26.7■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 PSMD14O00487 310 aa26.7■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 EPHX2P34913 555 aa26.7■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.7■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.7■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 EYA2O00167 538 aa26.69■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 SRGAP3O43295 1099 aa26.69■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 KLRK1P26718 216 aa26.69■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 SCNN1DP51172 638 aa26.69■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 UBE4AQ14139 1066 aa26.69■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
ABCD4-202ENST00000460308 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.68■■□□□ 1.86
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