RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 H3BQV1 296 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 ADORA1P30542 326 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 IFFO2Q5TF58 517 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 SPATA32Q96LK8 384 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 MRC1P22897 1456 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 PDCP20941 246 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 GPTP24298 496 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 KRT32Q14532 448 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 HS1BP3Q53T59 392 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 GTF3C6Q969F1 213 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 A0A0G2JS52 829 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 EYA2O00167 538 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 OFD1O75665 1012 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 HAND2P61296 217 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 GUCY1B3Q02153 619 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 SCRN1Q12765 414 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 PI16Q6UXB8 463 aa21.48■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 WASHC4Q2M389 1173 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 DACT1Q9NYF0 836 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 CPDO75976 1380 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 SPC24Q8NBT2 197 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 M0R2C6 588 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 BICD2Q8TD16 824 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 SLAIN2Q9P270 581 aa21.46■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 JCADQ9P266 1359 aa21.45■■□□□ 1.03
HPS3-202ENST00000460120 MAST3O60307 1309 aa21.45■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 AP5Z1O43299 807 aa21.45■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.45■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.45■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.45■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 SCARF1Q14162 830 aa21.44■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 DCCP43146 1447 aa21.44■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.43■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 E7EWF7 191 aa21.43■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 OSBP2Q969R2 916 aa21.43■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 KDM4AO75164 1064 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 TNMDQ9H2S6 317 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 GLI3P10071 1580 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 NR1I2O75469 434 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 MAP3K11Q16584 847 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 LUZP1Q86V48 1076 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 XAGE2Q96GT9 111 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 CCDC192P0DO97 292 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 HLFQ16534 295 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 PIGBQ92521 554 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 TCIRG1Q13488 830 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 UVSSAQ2YD98 709 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 PGBD1Q96JS3 809 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 ZAP70P43403 619 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 FAM177BA6PVY3 158 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 TYRO3Q06418 890 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 RESTQ13127 1097 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 CTDNEP1O95476 244 aa21.39■■□□□ 1.02
HPS3-202ENST00000460120 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS3-202ENST00000460120 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS3-202ENST00000460120 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HPS3-202ENST00000460120 PALLDQ8WX93 1383 aa21.39■■□□□ 1.01
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