RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	PIGB	Q92521	554 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1B0GUL7	405 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	SYT1	P21579	422 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	GJB2	P29033	226 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	PKP1	Q13835	747 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	FGD1	P98174	961 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	LRP5	O75197	1615 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	PDE8A	O60658	829 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT85	P78386	507 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-222	ENST00000459758	ELP1	O95163	1332 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXL16	Q8N461	479 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLIM4	O00461	696 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	CTSW	P56202	376 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	DDB1	Q16531	1140 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ME3	Q16798	604 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	CASZ1	Q86V15	1759 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	RTL9	Q8NET4	1388 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	APPBP2	Q92624	585 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ATRN	O75882	1429 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	MCM5	P33992	734 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	TIMM10	P62072	90 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ARX	Q96QS3	562 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758		H3BQV1	296 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	PFKFB2	O60825	505 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP21A2	P08686	494 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC5A1	P13866	664 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	ITGA6	P23229	1130 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-222	ENST00000459758	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23

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