RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450875.5

CITED1-208, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, human

TSL 2

Gene CITED1, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CITED1-208	ENST00000450875	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	GPSM2	P81274	684 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	AOC3	Q16853	763 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	WASHC4	Q2M389	1173 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	GGA1	Q9UJY5	639 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	SBF1	O95248	1867 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	TAF1	P21675	1872 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	XDH	P47989	1333 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	GLTPD2	A6NH11	291 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	UFL1	O94874	794 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	ATP2B4	P23634	1241 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	KCNJ4	P48050	445 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	SLC51A	Q86UW1	340 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CITED1-208	ENST00000450875	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		10.15	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	TNN	Q9UQP3	1299 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	PLIN1	O60240	522 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	KAZALD1	Q96I82	304 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	MEIS3	Q99687	375 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	RRAGC	Q9HB90	399 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	POLL	Q9UGP5	575 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	SNED1	Q8TER0	1413 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	FZD9	O00144	591 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	GNAI2	P04899	355 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	CHRND	Q07001	517 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	TAF5L	O75529	589 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	TNIP1	Q15025	636 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	DOK7	Q18PE1	504 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	GPC2	Q8N158	579 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	SPEF2	Q9C093	1822 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	COL4A1	P02462	1669 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	ECE2	O60344	883 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	RAD17	O75943	681 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	METTL24	Q5JXM2	366 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	PANK1	Q8TE04	598 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	SRGAP3	O43295	1099 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	RLBP1	P12271	317 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	CXCL9	Q07325	125 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	FBXW7	Q969H0	707 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	SIL1	Q9H173	461 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CITED1-208	ENST00000450875	KIF3C	O14782	793 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	TOMM70	O94826	608 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	LRRC24	Q50LG9	513 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	PODN	Q7Z5L7	613 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	COA1	Q9GZY4	146 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	HACL1	Q9UJ83	578 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	COG6	Q9Y2V7	657 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	MED23	Q9ULK4	1368 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	YDJC	A8MPS7	323 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	EYA2	O00167	538 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	UBE4A	Q14139	1066 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CITED1-208	ENST00000450875	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8

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