RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447232.6

PMS1-215, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 2,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-215	ENST00000447232	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PMS1-215	ENST00000447232	ZMYND10	O75800	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMS1-215	ENST00000447232	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMS1-215	ENST00000447232	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMS1-215	ENST00000447232	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PMS1-215	ENST00000447232	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PMS1-215	ENST00000447232	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	CYP27B1	O15528	508 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	TM4SF1	P30408	202 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	RFC4	P35249	363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	GUCA2A	Q02747	115 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	CST9	Q5W186	159 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	EPHX2	P34913	555 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	GRM1	Q13255	1194 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	NME9	Q86XW9	330 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	AAAS	Q9NRG9	546 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	ST8SIA5	O15466	376 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	TRIM32	Q13049	653 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	HOXC9	P31274	260 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	ATG3	Q9NT62	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	AVP	P01185	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	CYP4X1	Q8N118	509 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	WNT7A	O00755	349 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	AMHR2	Q16671	573 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	ZIC5	Q96T25	663 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	EVC2	Q86UK5	1308 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	C21orf2	O43822	256 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232		H0YIN7	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	TRAF5	O00463	557 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	NOG	Q13253	232 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	RETREG3	Q86VR2	466 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	DACH1	Q9UI36	760 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	FDX1	P10109	184 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	SLX4	Q8IY92	1834 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	JUND	P17535	347 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	NDUFV2	P19404	249 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	SKOR1	P84550	965 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	NFIX	Q14938	502 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		4.71	□□□□□ -1.65
PMS1-215	ENST00000447232	FZD9	O00144	591 aa		4.71	□□□□□ -1.65

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