RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 AFAP1Q8N556 730 aa7.57□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 CFAP157Q5JU67 520 aa7.57□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.57□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 FAM169AQ9Y6X4 670 aa7.56□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 TSPY8P0CW00 308 aa7.56□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 MICU3Q86XE3 530 aa7.56□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 CCT6BQ92526 530 aa7.56□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.56□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.56□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 NEK11Q8NG66 645 aa7.56□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.56□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.55□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.55□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 VCX3BQ9H321 246 aa7.55□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 VPS52Q8N1B4 723 aa7.55□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 KIFAP3Q92845 792 aa7.55□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.55□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 MCM6Q14566 821 aa7.55□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 FAM13AO94988 1023 aa7.55□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 GNA11P29992 359 aa7.55□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 SH2D4BQ5SQS7 431 aa7.55□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 CCDC42Q96M95 316 aa7.55□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 STK24Q9Y6E0 443 aa7.55□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 RTL9Q8NET4 1388 aa7.55□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 CIB2O75838 187 aa7.54□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 ATP11AP98196 1134 aa7.54□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.54□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 IL16Q14005 1332 aa7.54□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 EEF2P13639 858 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 ALG1Q9BT22 464 aa7.54□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 CALCOCO2Q13137 446 aa7.54□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 TAF12Q16514 161 aa7.54□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 RFC4P35249 363 aa7.54□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.54□□□□□ -1.2
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