RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 PLA2G12BQ9BX93 195 aa35.18■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 LTBP1Q14766 1721 aa35.18■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 YDJCA8MPS7 323 aa35.17■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 G3V3G9 751 aa35.17■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 DCAF8Q5TAQ9 597 aa35.17■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 SSH1Q8WYL5 1049 aa35.17■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 PODXL2Q9NZ53 605 aa35.17■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 CHMP3Q9Y3E7 222 aa35.17■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 ITGA6P23229 1130 aa35.16■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 TNIP1Q15025 636 aa35.16■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa35.16■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 RTL9Q8NET4 1388 aa35.15■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 XDHP47989 1333 aa35.15■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 ECE2O60344 883 aa35.14■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
FAAP20-210ENST00000440825 GRM8O00222 908 aa35.13■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 ALDH1L1O75891 902 aa35.12■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 MPHOSPH8Q99549 860 aa35.12■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 SMC4Q9NTJ3 1288 aa35.12■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 GPRC5DQ9NZD1 345 aa35.12■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 MINPP1Q9UNW1 487 aa35.12■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 CSF1RP07333 972 aa35.11■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 ATP2B4P23634 1241 aa35.1■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 PTPRCP08575 1304 aa35.09■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa35.09■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 PSMD14O00487 310 aa35.09■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 FOXO4P98177 505 aa35.09■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa35.09■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 KCNQ5Q9NR82 932 aa35.09■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa35.08■■■■□ 3.21
FAAP20-210ENST00000440825 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 ALDH1L2Q3SY69 923 aa35.07■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 LMBR1LQ6UX01 489 aa35.07■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 EPHA10Q5JZY3 1008 aa35.06■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 CNTROBQ8N137 903 aa35.06■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 CCT4P50991 539 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 SHTN1A0MZ66 631 aa35.03■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 TAF7LQ5H9L4 462 aa35.03■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 KLRG1Q96E93 195 aa35.03■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 MICALL2Q8IY33 904 aa35.02■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 SUCLG2Q96I99 432 aa35.02■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 PASKQ96RG2 1323 aa35.02■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 H7C1D1 291 aa35.01■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP35.01■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC57Q2TAC2 916 aa35.01■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 ANKRD2Q9GZV1 360 aa35.01■■■■□ 3.2
FAAP20-210ENST00000440825 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 KCNJ4P48050 445 aa35■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 CHRNDQ07001 517 aa34.99■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 TRPM4Q8TD43 1214 aa34.98■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 CREBZFQ9NS37 354 aa34.98■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 LEMD3Q9Y2U8 911 aa34.98■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 SCN9AQ15858 1988 aa34.98■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 MED23Q9ULK4 1368 aa34.98■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 ZNF804BA4D1E1 1349 aa34.97■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 DPF2Q92785 391 aa34.96■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 TAF5LO75529 589 aa34.95■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 RPS12P25398 132 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 FBXW7Q969H0 707 aa34.95■■■■□ 3.19
FAAP20-210ENST00000440825 VIL1P09327 827 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 SAMD7Q7Z3H4 446 aa34.94■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 CNNM1Q9NRU3 951 aa34.94■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 UTYO14607 1347 aa34.93■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM88BA6NKF7 163 aa34.93■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 PLIN1O60240 522 aa34.93■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 KLRK1P26718 216 aa34.93■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP34.93■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa34.93■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 PODNQ7Z5L7 613 aa34.93■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 TXNRD3Q86VQ6 643 aa34.93■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 KAZALD1Q96I82 304 aa34.93■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 RARSP54136 660 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 SNAP23O00161 211 aa34.91■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 TRAF5O00463 557 aa34.91■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 USP17L3A6NCW0 530 aa34.9■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 USP17L4A6NCW7 530 aa34.9■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 USP17L1Q7RTZ2 530 aa34.9■■■■□ 3.18
FAAP20-210ENST00000440825 COA1Q9GZY4 146 aa34.89■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms