RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 TATP17735 454 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 CABP4P57796 275 aa16■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 POLA2Q14181 598 aa16■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 AMOTQ4VCS5 1084 aa16■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 VWDEQ8N2E2 1590 aa16■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa16■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.99■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 CRB1P82279 1406 aa15.99■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 MICU3Q86XE3 530 aa15.99■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.98■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 CHRNA2Q15822 529 aa15.97■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 LRRC8AQ8IWT6 810 aa15.97■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 CYP21A2P08686 494 aa15.96■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 SCRN1Q12765 414 aa15.96■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 TNNI3KQ59H18 835 aa15.96■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 CAVIN2O95810 425 aa15.96■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 FAM160A1Q05DH4 1040 aa15.96■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 IP6K1Q92551 441 aa15.96■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SGMS1-203ENST00000429490 NUP133Q8WUM0 1156 aa15.96■□□□□ 0.15
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SGMS1-203ENST00000429490 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 SPTLC2O15270 562 aa15.95■□□□□ 0.14
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SGMS1-203ENST00000429490 GNG11P61952 73 aa15.95■□□□□ 0.14
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SGMS1-203ENST00000429490 PPLO60437 1756 aa15.95■□□□□ 0.14
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SGMS1-203ENST00000429490 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF213O14771 459 aa15.94■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 GCP02774 474 aa15.94■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 SYKP43405 635 aa15.94■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 JMYQ8N9B5 988 aa15.94■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 CNNM3Q8NE01 707 aa15.94■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.94■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 GPS2Q13227 327 aa15.94■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 GCKRQ14397 625 aa15.94■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC34Q96HJ3 373 aa15.94■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.94■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 CTNNA3Q9UI47 895 aa15.94■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 SPECC1Q5M775 1068 aa15.93■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.93■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.93■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SGMS1-203ENST00000429490 MTMR7Q9Y216 660 aa15.93■□□□□ 0.14
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