RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.91e-11■■■■□ 22.7
LIMS1-208ENST00000428064 WBP1LQ9NX94 342 aa26.94■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 RTL9Q8NET4 1388 aa26.94■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 FOXN1O15353 648 aa26.93■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 CTSWP56202 376 aa26.93■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 MICALL2Q8IY33 904 aa26.93■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.93■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 TLL2Q9Y6L7 1015 aa26.93■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 PSME4Q14997 1843 aa26.93■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.92■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.92■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 WDR63Q8IWG1 891 aa26.92■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 AIDAQ96BJ3 306 aa26.92■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.92■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 GGA1Q9UJY5 639 aa26.92■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 SCN9AQ15858 1988 aa26.91■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.91■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 UFL1O94874 794 aa26.91■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 SLC4A2P04920 1241 aa26.91■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 ECE1P42892 770 aa26.91■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.91■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 XDHP47989 1333 aa26.9■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 DOK7Q18PE1 504 aa26.9■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.9■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 SHTN1A0MZ66 631 aa26.89■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 G2E3Q7L622 706 aa26.89■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.89■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 HHIPL1Q96JK4 782 aa26.89■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
LIMS1-208ENST00000428064 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 FLIIQ13045 1269 aa26.88■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 CAPNS2Q96L46 248 aa26.88■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 H7C1W4 665 aa26.87■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 CELF2O95319 508 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 SAPCD2Q86UD0 394 aa26.87■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.87■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 SPEF2Q9C093 1822 aa26.87■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 ATP2B4P23634 1241 aa26.86■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.86■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.85■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 GREM2Q9H772 168 aa26.85■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 VAMP4O75379 141 aa26.84■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 GCKRQ14397 625 aa26.84■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 CYP4F22Q6NT55 531 aa26.84■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 MED23Q9ULK4 1368 aa26.84■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 G3V3G9 751 aa26.83■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.83■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.83■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 LINS1Q8NG48 757 aa26.83■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.83■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.83■■□□□ 1.89
LIMS1-208ENST00000428064 EGFRP00533 1210 aa26.82■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 MAP2K2P36507 400 aa26.82■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 PODNQ7Z5L7 613 aa26.82■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.82■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 CASP7P55210 303 aa26.81■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.81■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.8■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 USP48Q86UV5 1035 aa26.79■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 CSF1RP07333 972 aa26.78■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 LBX1P52954 281 aa26.78■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 KRT26Q7Z3Y9 468 aa26.78■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 GMLQ99445 158 aa26.77■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.77■■□□□ 1.88
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L3A6NCW0 530 aa26.76■■□□□ 1.87
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L4A6NCW7 530 aa26.76■■□□□ 1.87
LIMS1-208ENST00000428064 ITGA6P23229 1130 aa26.76■■□□□ 1.87
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.76■■□□□ 1.87
LIMS1-208ENST00000428064 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
LIMS1-208ENST00000428064 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.76■■□□□ 1.87
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
LIMS1-208ENST00000428064 GRM1Q13255 1194 aa26.75■■□□□ 1.87
LIMS1-208ENST00000428064 BEGAINQ9BUH8 593 aa26.75■■□□□ 1.87
LIMS1-208ENST00000428064 FAM161AQ3B820 660 aa26.74■■□□□ 1.87
LIMS1-208ENST00000428064 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
LIMS1-208ENST00000428064 GGA3Q9NZ52 723 aa26.74■■□□□ 1.87
LIMS1-208ENST00000428064 AOC2O75106 756 aa26.73■■□□□ 1.87
LIMS1-208ENST00000428064 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
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