RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPON1Q9HCB6 807 aa20.85■□□□□ 0.93
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNNI3KQ59H18 835 aa20.83■□□□□ 0.92
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TOP3BP1-201ENST00000420768 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP2B4P23634 1241 aa20.72■□□□□ 0.91
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.72■□□□□ 0.91
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.71■□□□□ 0.91
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP5JP18859 108 aa20.71■□□□□ 0.91
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPSM2P81274 684 aa20.71■□□□□ 0.91
TOP3BP1-201ENST00000420768 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.71■□□□□ 0.91
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.71■□□□□ 0.91
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KLHL34Q8N239 644 aa20.7■□□□□ 0.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.7■□□□□ 0.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNAP23O00161 211 aa20.69■□□□□ 0.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.69■□□□□ 0.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.69■□□□□ 0.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPNDQ8N594 471 aa20.69■□□□□ 0.9
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SOGA3Q5TF21 947 aa20.68■□□□□ 0.9
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