RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.44■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 AK9Q5TCS8 1911 aa25.44■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 XAGE2Q96GT9 111 aa25.43■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 SNX21Q969T3 373 aa25.42■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.42■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 COL4A1P02462 1669 aa25.42■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 PDE8BO95263 885 aa25.42■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.42■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 ZNF827Q17R98 1081 aa25.41■■□□□ 1.66
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GPC1-202ENST00000420138 ATP2B3Q16720 1220 aa25.4■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 FAM227BQ96M60 508 aa25.4■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 FSD1Q9BTV5 496 aa25.4■■□□□ 1.66
GPC1-202ENST00000420138 SNRKQ9NRH2 765 aa25.4■■□□□ 1.66
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GPC1-202ENST00000420138 HIP1O00291 1037 aa25.39■■□□□ 1.65
GPC1-202ENST00000420138 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
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GPC1-202ENST00000420138 FGFR2P21802 821 aa25.38■■□□□ 1.65
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GPC1-202ENST00000420138 RAD50Q92878 1312 aa25.38■■□□□ 1.65
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GPC1-202ENST00000420138 BAG6P46379 1132 aa25.37■■□□□ 1.65
GPC1-202ENST00000420138 PALD1Q9ULE6 856 aa25.37■■□□□ 1.65
GPC1-202ENST00000420138 A0A0D9SFI3 127 aa25.37■■□□□ 1.65
GPC1-202ENST00000420138 GYS1P13807 737 aa25.37■■□□□ 1.65
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GPC1-202ENST00000420138 RABEP1Q15276 862 aa25.37■■□□□ 1.65
GPC1-202ENST00000420138 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.37■■□□□ 1.65
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GPC1-202ENST00000420138 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.36■■□□□ 1.65
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GPC1-202ENST00000420138 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.36■■□□□ 1.65
GPC1-202ENST00000420138 HSPA4P34932 840 aa25.35■■□□□ 1.65
GPC1-202ENST00000420138 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
GPC1-202ENST00000420138 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.35■■□□□ 1.65
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GPC1-202ENST00000420138 CHGBP05060 677 aa25.35■■□□□ 1.65
GPC1-202ENST00000420138 SCARF1Q14162 830 aa25.35■■□□□ 1.65
GPC1-202ENST00000420138 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.35■■□□□ 1.65
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GPC1-202ENST00000420138 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.33■■□□□ 1.65
GPC1-202ENST00000420138 GORABQ5T7V8 394 aa25.33■■□□□ 1.65
GPC1-202ENST00000420138 LPIN2Q92539 896 aa25.33■■□□□ 1.65
GPC1-202ENST00000420138 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
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GPC1-202ENST00000420138 HSCBQ8IWL3 235 aa25.33■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.33■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 NLRP3Q96P20 1036 aa25.33■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.33■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 SNAP23O00161 211 aa25.32■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 MCCP23508 829 aa25.32■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.32■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 TM4SF1P30408 202 aa25.31■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.31■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 TICAM2Q86XR7 235 aa25.31■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
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GPC1-202ENST00000420138 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.3■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.3■■□□□ 1.64
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GPC1-202ENST00000420138 CCDC102BQ68D86 513 aa25.29■■□□□ 1.64
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GPC1-202ENST00000420138 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.28■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 NPHP1O15259 732 aa25.28■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 ZAP70P43403 619 aa25.28■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 PHKA1P46020 1223 aa25.28■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 SLC15A2Q16348 729 aa25.28■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.28■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 CCDC125Q86Z20 511 aa25.28■■□□□ 1.64
GPC1-202ENST00000420138 MAP4K1Q92918 833 aa25.28■■□□□ 1.64
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