RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418601.1

GTPBP1-202, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 810 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-202ENST00000418601 SREBF2Q12772 1141 aa25.41■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 NLRP10Q86W26 655 aa25.41■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.4■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 GPSM2P81274 684 aa25.4■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF609O15014 1411 aa25.39■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.39■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.39■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.39■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 TRIM17Q9Y577 477 aa25.39■■□□□ 1.66
GTPBP1-202ENST00000418601 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.38■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 PSME4Q14997 1843 aa25.38■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.38■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 ANXA1P04083 346 aa25.36■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 G3V3G9 751 aa25.35■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 PROSER3Q2NL68 480 aa25.35■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.35■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.35■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.35■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.35■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF428Q96B54 188 aa25.35■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 PDIA6Q15084 440 aa25.34■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.34■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.33■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
GTPBP1-202ENST00000418601 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.32■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 NF2P35240 595 aa25.31■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 TCIRG1Q13488 830 aa25.31■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 BRCA2P51587 3418 aa25.31■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 USP17L8P0C7I0 530 aa25.3■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 CENPFP49454 3210 aa25.3■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 DLL1O00548 723 aa25.29■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 UFL1O94874 794 aa25.29■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 ALDH1A1P00352 501 aa25.29■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 COPS6Q7L5N1 327 aa25.29■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.28■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 NEFMP07197 916 aa25.27■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.27■■□□□ 1.64
GTPBP1-202ENST00000418601 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 PRKG1Q13976 671 aa25.26■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 ARMC5Q96C12 935 aa25.26■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 GMLQ99445 158 aa25.26■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.25■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 SPRYD7Q5W111 196 aa25.25■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 NECTIN2Q92692 538 aa25.25■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 FAM89AQ96GI7 184 aa25.25■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.25■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.25■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 LAMB1P07942 1786 aa25.25■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.24■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.24■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 ERO1AQ96HE7 468 aa25.24■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.24■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 GGA1Q9UJY5 639 aa25.24■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 IFNL1Q8IU54 200 aa25.23■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 SZT2Q5T011 3432 aa25.22■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 PPP2R1AP30153 589 aa25.21■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.21■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.21■■□□□ 1.63
GTPBP1-202ENST00000418601 USP17L3A6NCW0 530 aa25.2■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 USP17L4A6NCW7 530 aa25.2■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 NFE2L2Q16236 605 aa25.2■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.2■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 H0YGN5 161 aa25.19■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 EFCC1Q9HA90 598 aa25.19■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.19■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 WNT10BO00744 389 aa25.18■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.18■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.18■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 OTUD5Q96G74 571 aa25.18■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 SASH1O94885 1247 aa25.17■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 INHBEP58166 350 aa25.17■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF333Q96JL9 665 aa25.17■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 FZD1Q9UP38 647 aa25.17■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.16■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.15■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 PODNQ7Z5L7 613 aa25.15■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 OGFOD1Q8N543 542 aa25.15■■□□□ 1.62
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