RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417058.6

CD27-AS1-202, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 1,497 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-202ENST00000417058 NPR1P16066 1061 aa12.23□□□□□ -0.45
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CD27-AS1-202ENST00000417058 PODXL2Q9NZ53 605 aa12.15□□□□□ -0.46
CD27-AS1-202ENST00000417058 PIM2Q9P1W9 311 aa12.15□□□□□ -0.46
CD27-AS1-202ENST00000417058 UTRNP46939 3433 aa12.15□□□□□ -0.46
CD27-AS1-202ENST00000417058 CACNA1SQ13698 1873 aa12.15□□□□□ -0.46
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CD27-AS1-202ENST00000417058 SNAP23O00161 211 aa12.14□□□□□ -0.47
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CD27-AS1-202ENST00000417058 UBE4AQ14139 1066 aa12.14□□□□□ -0.47
CD27-AS1-202ENST00000417058 ATP2B3Q16720 1220 aa12.14□□□□□ -0.47
CD27-AS1-202ENST00000417058 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa12.14□□□□□ -0.47
CD27-AS1-202ENST00000417058 LPIN2Q92539 896 aa12.14□□□□□ -0.47
CD27-AS1-202ENST00000417058 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CD27-AS1-202ENST00000417058 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CD27-AS1-202ENST00000417058 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CD27-AS1-202ENST00000417058 XDHP47989 1333 aa12.14□□□□□ -0.47
CD27-AS1-202ENST00000417058 SNED1Q8TER0 1413 aa12.14□□□□□ -0.47
CD27-AS1-202ENST00000417058 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CD27-AS1-202ENST00000417058 GPSM2P81274 684 aa12.14□□□□□ -0.47
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