RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 XDHP47989 1333 aa22.64■■□□□ 1.22
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SEMA3B-201ENST00000416295 EYA3Q99504 573 aa22.64■■□□□ 1.21
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SEMA3B-201ENST00000416295 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.55■■□□□ 1.2
SEMA3B-201ENST00000416295 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.55■■□□□ 1.2
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SEMA3B-201ENST00000416295 RAD17O75943 681 aa22.5■■□□□ 1.19
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SEMA3B-201ENST00000416295 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.5■■□□□ 1.19
SEMA3B-201ENST00000416295 HACL1Q9UJ83 578 aa22.5■■□□□ 1.19
SEMA3B-201ENST00000416295 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.5■■□□□ 1.19
SEMA3B-201ENST00000416295 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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SEMA3B-201ENST00000416295 RLBP1P12271 317 aa22.49■■□□□ 1.19
SEMA3B-201ENST00000416295 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SEMA3B-201ENST00000416295 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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SEMA3B-201ENST00000416295 TAF5LO75529 589 aa22.48■■□□□ 1.19
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SEMA3B-201ENST00000416295 PLIN1O60240 522 aa22.47■■□□□ 1.19
SEMA3B-201ENST00000416295 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SEMA3B-201ENST00000416295 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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SEMA3B-201ENST00000416295 COA1Q9GZY4 146 aa22.47■■□□□ 1.19
SEMA3B-201ENST00000416295 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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SEMA3B-201ENST00000416295 FBXO3Q9UK99 471 aa22.46■■□□□ 1.19
SEMA3B-201ENST00000416295 EYA2O00167 538 aa22.45■■□□□ 1.18
SEMA3B-201ENST00000416295 PSMD14O00487 310 aa22.45■■□□□ 1.18
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SEMA3B-201ENST00000416295 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SEMA3B-201ENST00000416295 METTL24Q5JXM2 366 aa22.45■■□□□ 1.18
SEMA3B-201ENST00000416295 KLRG1Q96E93 195 aa22.45■■□□□ 1.18
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