RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD2Q9GZV1 360 aa10.8□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSME4Q14997 1843 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF609O15014 1411 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITGA6P23229 1130 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP2B4P23634 1241 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FSTL1Q12841 308 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WASHC4Q2M389 1173 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC57Q2TAC2 916 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MPHOSPH8Q99549 860 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BCL2L13Q9BXK5 485 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GREM2Q9H772 168 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NMRK2Q9NPI5 230 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEC31BQ9NQW1 1179 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GGA1Q9UJY5 639 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNRF3Q9ULT6 936 aa10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MED23Q9ULK4 1368 aa10.78□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNIP1Q15025 636 aa10.78□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AOC3Q16853 763 aa10.78□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM161AQ3B820 660 aa10.78□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBC1D16Q8TBP0 767 aa10.78□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LEMD3Q9Y2U8 911 aa10.78□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1B0GUL6 1792 aa10.77□□□□□ -0.68
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL4A1P02462 1669 aa10.77□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL4A5P29400 1685 aa10.77□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C6orf229H3BNL8 230 aa10.77□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UFL1O94874 794 aa10.77□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPSM2P81274 684 aa10.77□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FOXO4P98177 505 aa10.77□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMC1BQ8NDV3 1235 aa10.77□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF541Q9H0D2 1346 aa10.77□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDNO94850 711 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GNAI3P08754 354 aa10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPS12P25398 132 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MMP14P50281 582 aa10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLA2Q14181 598 aa10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CIAPIN1Q6FI81 312 aa10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LMBR1LQ6UX01 489 aa10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RRAGCQ9HB90 399 aa10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HACL1Q9UJ83 578 aa10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FBXO3Q9UK99 471 aa10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.76□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 G3V3G9 751 aa10.75□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MS4A1P11836 297 aa10.75□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.75□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa10.75□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PODNQ7Z5L7 613 aa10.75□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SUCLG2Q96I99 432 aa10.75□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP44Q9H0E7 712 aa10.75□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLLQ9UGP5 575 aa10.75□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.75□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.75□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa10.74□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LDHDQ86WU2 507 aa10.74□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DPF2Q92785 391 aa10.74□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POTECB2RU33 542 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ECE2O60344 883 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM27P14373 513 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSPA6P17066 643 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EPHX2P34913 555 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNJ4P48050 445 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHRNDQ07001 517 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CXCL9Q07325 125 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KAZALD1Q96I82 304 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COA1Q9GZY4 146 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CNNM1Q9NRU3 951 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF804BA4D1E1 1349 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MROH5Q6ZUA9 1318 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYO3BQ8WXR4 1341 aa10.73□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCN9AQ15858 1988 aa10.72□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCNN1DP51172 638 aa10.72□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 APLP1P51693 650 aa10.72□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBE4AQ14139 1066 aa10.72□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EPHA10Q5JZY3 1008 aa10.72□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHADLQ6NUI6 762 aa10.72□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD44Q8N8A2 993 aa10.72□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPRC5DQ9NZD1 345 aa10.72□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GJA3Q9Y6H8 435 aa10.72□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 YDJCA8MPS7 323 aa10.71□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BCAR3O75815 825 aa10.71□□□□□ -0.69
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VIL1P09327 827 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms