RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 PANK1Q8TE04 598 aa34.33■■■■□ 3.09
FAAP20-204ENST00000400919 EYA3Q99504 573 aa34.33■■■■□ 3.09
FAAP20-204ENST00000400919 ANKRD2Q9GZV1 360 aa34.33■■■■□ 3.09
FAAP20-204ENST00000400919 GGA1Q9UJY5 639 aa34.33■■■■□ 3.09
FAAP20-204ENST00000400919 PLIN1O60240 522 aa34.32■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 GNAI2P04899 355 aa34.32■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 CNNM1Q9NRU3 951 aa34.31■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 SBF1O95248 1867 aa34.31■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 WASHC4Q2M389 1173 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 DPY19L2Q6NUT2 758 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 TBC1D16Q8TBP0 767 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 POLLQ9UGP5 575 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC37AA6NMS7 1700 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 UFL1O94874 794 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 ATP2B4P23634 1241 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 AOC3Q16853 763 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 KIAA2012Q0VF49 1180 aa34.29■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 NIM1KQ8IY84 436 aa34.29■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 PDE3AQ14432 1141 aa34.28■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 CHRNDQ07001 517 aa34.27■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
FAAP20-204ENST00000400919 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 LEMD3Q9Y2U8 911 aa34.26■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 KDM2BQ8NHM5 1336 aa34.26■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 MVPQ14764 893 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 DDX19BQ9UMR2 479 aa34.24■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 GLTPD2A6NH11 291 aa34.23■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 FZD9O00144 591 aa34.23■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 KCNJ4P48050 445 aa34.23■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 EIF6P56537 245 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 RIMBP2O15034 1052 aa34.22■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 MTX1Q13505 466 aa34.22■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 COG6Q9Y2V7 657 aa34.22■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 DUOX1Q9NRD9 1551 aa34.22■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 ZNRF3Q9ULT6 936 aa34.21■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF804BA4D1E1 1349 aa34.21■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 MROH5Q6ZUA9 1318 aa34.21■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 G3V3G9 751 aa34.21■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 SRGAP3O43295 1099 aa34.21■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 DCAF8Q5TAQ9 597 aa34.21■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa34.2■■■■□ 3.07
FAAP20-204ENST00000400919 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 KLHDC4Q8TBB5 520 aa34.2■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 FBXO3Q9UK99 471 aa34.2■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa34.2■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 TAF5LO75529 589 aa34.17■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 RRP1P56182 461 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 EYA2O00167 538 aa34.16■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC24Q50LG9 513 aa34.16■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 LTBP1Q14766 1721 aa34.16■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 TIAM2Q8IVF5 1701 aa34.16■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 MED23Q9ULK4 1368 aa34.16■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 METTL24Q5JXM2 366 aa34.15■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 C20orf194Q5TEA3 1177 aa34.15■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 C1orf115Q9H7X2 142 aa34.14■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 DBNDD1Q9H9R9 158 aa34.14■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 COPRSQ9NQ92 184 aa34.14■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 SPEF2Q9C093 1822 aa34.14■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF541Q9H0D2 1346 aa34.14■■■■□ 3.06
FAAP20-204ENST00000400919 CIAO1O76071 339 aa34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 DDNO94850 711 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 DOK7Q18PE1 504 aa34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 GPC2Q8N158 579 aa34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 COL4A5P29400 1685 aa34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 ECE2O60344 883 aa34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 SIL1Q9H173 461 aa34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 ATP8B2P98198 1209 aa34.12■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 UBE4AQ14139 1066 aa34.11■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 TNIP1Q15025 636 aa34.11■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 GJA3Q9Y6H8 435 aa34.11■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa34.1■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 PDE8BO95263 885 aa34.1■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 IL15P40933 162 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 CXCL9Q07325 125 aa34.1■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa34.1■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 CIAPIN1Q6FI81 312 aa34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 PODNQ7Z5L7 613 aa34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 COA1Q9GZY4 146 aa34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 NMRK2Q9NPI5 230 aa34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 RRAGCQ9HB90 399 aa34.08■■■■□ 3.05
FAAP20-204ENST00000400919 YDJCA8MPS7 323 aa34.07■■■■□ 3.04
FAAP20-204ENST00000400919 SNAP23O00161 211 aa34.07■■■■□ 3.04
FAAP20-204ENST00000400919 RAD17O75943 681 aa34.07■■■■□ 3.04
FAAP20-204ENST00000400919 ATG9AQ7Z3C6 839 aa34.07■■■■□ 3.04
FAAP20-204ENST00000400919 CEP126Q9P2H0 1117 aa34.07■■■■□ 3.04
FAAP20-204ENST00000400919 VGLL2Q8N8G2 317 aa34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms