RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 AFMP43652 599 aa19.81■□□□□ 0.76
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SH3BP4-202ENST00000392011 DDB1Q16531 1140 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 HSPA2P54652 639 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 CBX1P83916 185 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM200AQ8TCP9 573 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 DISP1Q96F81 1524 aa19.8■□□□□ 0.76
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SH3BP4-202ENST00000392011 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
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SH3BP4-202ENST00000392011 N4BP3O15049 544 aa19.79■□□□□ 0.76
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SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.78■□□□□ 0.76
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SH3BP4-202ENST00000392011 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 VPS36Q86VN1 386 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 FEZ1Q99689 392 aa19.78■□□□□ 0.76
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SH3BP4-202ENST00000392011 TSPY8P0CW00 308 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC40Q4G0X9 1142 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF790Q6PG37 636 aa19.77■□□□□ 0.76
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SH3BP4-202ENST00000392011 FAM89AQ96GI7 184 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 USO1O60763 962 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA0754O94854 1291 aa19.77■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 SYT1P21579 422 aa19.77■□□□□ 0.75
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SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC171Q6TFL3 1326 aa19.76■□□□□ 0.75
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SH3BP4-202ENST00000392011 SPTLC2O15270 562 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 GNG11P61952 73 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 PTPDC1A2A3K4 754 aa19.75■□□□□ 0.75
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SH3BP4-202ENST00000392011 AOPEPQ8N6M6 819 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM47Q96LD4 638 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD62A6NC57 917 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 PAFAH1B1P43034 410 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 CABP5Q9NP86 173 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 SKILP12757 684 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 LUZP1Q86V48 1076 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 MAGEB6Q8N7X4 407 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 TRPM2O94759 1503 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCC2Q92887 1545 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 RRAGBQ5VZM2 374 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 PRDM10Q9NQV6 1147 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 GSTO1P78417 241 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 TYRO3Q06418 890 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 DBNDD2Q9BQY9 259 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 USP19O94966 1318 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 ADGRL2O95490 1459 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 PTPRTO14522 1441 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 DTNBO60941 627 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 LIG1P18858 919 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 CEP135Q66GS9 1140 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 SBNO1A3KN83 1393 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 ST5P78524 1137 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC150Q8NCX0 1101 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 C8orf37Q96NL8 207 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
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