RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368309.3

UBQLN4-201, Transcript of ubiquilin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN4, Length 3,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4-201ENST00000368309 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.44■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 A0A1B0GUL7 405 aa21.44■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 IL2RBP14784 551 aa21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 FOSBP53539 338 aa21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 SPATA32Q96LK8 384 aa21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.43■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 MCM5P33992 734 aa21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 SCRN1Q12765 414 aa21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 KDM4AO75164 1064 aa21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 CHST3Q7LGC8 479 aa21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 EVA1CP58658 441 aa21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 H3BQV1 296 aa21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 IFFO2Q5TF58 517 aa21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 DACT1Q9NYF0 836 aa21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 APOBRQ0VD83 1088 aa21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 FAM89AQ96GI7 184 aa21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 AP5Z1O43299 807 aa21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 GPR108Q9NPR9 543 aa21.4■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 ABCC6O95255 1503 aa21.39■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.39■■□□□ 1.02
UBQLN4-201ENST00000368309 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.39■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 GLI3P10071 1580 aa21.39■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 CCDC192P0DO97 292 aa21.39■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 ELP1O95163 1332 aa21.39■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 GORABQ5T7V8 394 aa21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 ADORA1P30542 326 aa21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 TPM2P07951 284 aa21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 MAP3K11Q16584 847 aa21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 SLAIN2Q9P270 581 aa21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 MAST3O60307 1309 aa21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.38■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 SYNE4Q8N205 404 aa21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 PALLDQ8WX93 1383 aa21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 TCIRG1Q13488 830 aa21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 E7EWF7 191 aa21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 M0R2C6 588 aa21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 PGBD1Q96JS3 809 aa21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 TNMDQ9H2S6 317 aa21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.37■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 RESTQ13127 1097 aa21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 OSBP2Q969R2 916 aa21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 BICD2Q8TD16 824 aa21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 ISCA1Q9BUE6 129 aa21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 PFKFB2O60825 505 aa21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 NR1I2O75469 434 aa21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 CIAO1O76071 339 aa21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 CTDNEP1O95476 244 aa21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 WASHC4Q2M389 1173 aa21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 XAGE2Q96GT9 111 aa21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 TYRO3Q06418 890 aa21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.35■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 HAND2P61296 217 aa21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 SCARF1Q14162 830 aa21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 SPC24Q8NBT2 197 aa21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.34■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 GPTP24298 496 aa21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 GUCY1B3Q02153 619 aa21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 PI16Q6UXB8 463 aa21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 LUZP1Q86V48 1076 aa21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
UBQLN4-201ENST00000368309 ATG3Q9NT62 314 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms