RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC102BQ68D86 513 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 C3orf67Q6ZVT6 689 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PODNQ7Z5L7 613 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF408Q9H9D4 720 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 MPSTP25325 297 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SCNN1DP51172 638 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 FUT2Q10981 343 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 BRICD5Q6PL45 260 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 C7orf43Q8WVR3 580 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SLC4A5Q9BY07 1137 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 COX20Q5RI15 118 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ALG1LQ6GMV1 187 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CYB5RLQ6IPT4 315 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 TRPM4Q8TD43 1214 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 TSC1Q92574 1164 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 LMO7Q8WWI1 1683 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SBF2Q86WG5 1849 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 NBPF26B4DH59 902 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 NEFLP07196 543 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 GTF2IP78347 998 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 LONRF3Q496Y0 759 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SPOCK3Q9BQ16 436 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF69Q9UC07 566 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 LRFN2Q9ULH4 789 aa3.38□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 FAM83GA6ND36 823 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ABL1P00519 1130 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 THNSL2Q86YJ6 484 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PGBD3Q8N328 593 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB39O15060 712 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PAX3P23760 479 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 HDGFP51858 240 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 USP48Q86UV5 1035 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC146Q8IYE0 955 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 TPCN2Q8NHX9 752 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 NOD1Q9Y239 953 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SETQ01105 290 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PAK2Q13177 524 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM95Q3KNT9 176 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 GAS2L2Q8NHY3 880 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 OSBPL7Q9BZF2 842 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF358Q9NW07 568 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 MAP10Q9P2G4 905 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 NRBP1Q9UHY1 535 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 GREM1O60565 184 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ETFBP38117 255 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ATP6V1AP38606 617 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 MTFR1Q15390 333 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PNMA3Q9UL41 463 aa3.37□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SOGA1O94964 1423 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 EYA4O95677 639 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CAPNS1P04632 268 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 MMP16P51512 607 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SH3TC2Q8TF17 1288 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CSRNP1Q96S65 589 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 EVA1BQ9NVM1 165 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 NUP188Q5SRE5 1749 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 THSD7BQ9C0I4 1608 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 GPRASP2Q96D09 838 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 EID1Q9Y6B2 187 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 FAM163BP0C2L3 166 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PDE3BQ13370 1112 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 TKFCQ3LXA3 575 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ERFEQ4G0M1 354 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SAMD3Q8N6K7 520 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 RPS6KC1Q96S38 1066 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ZBED2Q9BTP6 218 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ABCC3O15438 1527 aa3.36□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PRC1O43663 620 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 NR1I2O75469 434 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 JUNDP17535 347 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 NOS2P35228 1153 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 TM4SF20Q53R12 229 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PTPRMP28827 1452 aa3.35□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms