RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.69□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.69□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 ANKRD7Q92527 254 aa8.69□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 ITFG2Q969R8 447 aa8.69□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 RUNDC1Q96C34 613 aa8.69□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa8.68□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 EIF5P55010 431 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 NFIXQ14938 502 aa8.68□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 HLFQ16534 295 aa8.68□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.68□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TSPYL4Q9UJ04 414 aa8.68□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 GPR162Q16538 588 aa8.68□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 SUFUQ9UMX1 484 aa8.68□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 PXDNLA1KZ92 1463 aa8.68□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 PLCB2Q00722 1185 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 CCDC96Q2M329 555 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 ZPR1O75312 459 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TMX1Q9H3N1 280 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 STARD3NLO95772 234 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 DPEP1P16444 411 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 NUP98P52948 1817 aa8.67□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.66□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 CAMTA2O94983 1202 aa8.66□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 CHMP5Q9NZZ3 219 aa8.66□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 KCNA3P22001 575 aa8.66□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TM4SF1P30408 202 aa8.66□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.66□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TMTC2Q8N394 836 aa8.66□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.66□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 MBIPQ9NS73 344 aa8.66□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 NARFQ9UHQ1 456 aa8.66□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 C10orf71Q711Q0 1435 aa8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 KLHL33A6NCF5 533 aa8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 ERICH4A6NGS2 130 aa8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 CHD4Q14839 1912 aa8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 MTA1Q13330 715 aa8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 PDIA6Q15084 440 aa8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TSPYL6Q8N831 410 aa8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CCR6-202ENST00000349984 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 TNNT1P13805 278 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 ADRA2BP18089 450 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 GPTP24298 496 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 YY1P25490 414 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 CASQ1P31415 396 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 TOMM22Q9NS69 142 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 TAF1P21675 1872 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 SERPINB2P05120 415 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 BIRC2Q13490 618 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 OLFM4Q6UX06 510 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 JMYQ8N9B5 988 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 KIF3CO14782 793 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 IGHDP01880 384 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 SYNE4Q8N205 404 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 C8orf58Q8NAV2 365 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 BCS1LQ9Y276 419 aa8.64□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.63□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.63□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.63□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 CHL1O00533 1208 aa8.63□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.63□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 FAM210AQ96ND0 272 aa8.63□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 NBPF3Q9H094 633 aa8.63□□□□□ -1.03
CCR6-202ENST00000349984 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms