RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 KCNG4Q8TDN1 519 aa18.02■□□□□ 0.48
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PTPRU-201ENST00000345512 PAG1Q9NWQ8 432 aa18.02■□□□□ 0.48
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0D9SFI3 127 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRU-201ENST00000345512 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
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PTPRU-201ENST00000345512 A0A1B0GVL5 298 aa18.01■□□□□ 0.47
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PTPRU-201ENST00000345512 LEKR1Q6ZMV7 388 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRU-201ENST00000345512 OGFRQ9NZT2 677 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM2Q9UHN6 1383 aa17.97■□□□□ 0.47
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PTPRU-201ENST00000345512 ERLIN1O75477 346 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-201ENST00000345512 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-201ENST00000345512 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-201ENST00000345512 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-201ENST00000345512 MAP4K1Q92918 833 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-201ENST00000345512 TRERF1Q96PN7 1200 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-201ENST00000345512 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-201ENST00000345512 SKIDA1Q1XH10 827 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRU-201ENST00000345512 TXLNAP40222 546 aa17.96■□□□□ 0.46
PTPRU-201ENST00000345512 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.46
PTPRU-201ENST00000345512 LRP2BPQ9P2M1 347 aa17.96■□□□□ 0.46
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PTPRU-201ENST00000345512 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRU-201ENST00000345512 NRBP1Q9UHY1 535 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRU-201ENST00000345512 MRVI1Q9Y6F6 885 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRU-201ENST00000345512 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa17.95■□□□□ 0.46
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PTPRU-201ENST00000345512 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PTPRU-201ENST00000345512 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PTPRU-201ENST00000345512 GCKRQ14397 625 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRU-201ENST00000345512 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRU-201ENST00000345512 SLC26A6Q9BXS9 759 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRU-201ENST00000345512 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRU-201ENST00000345512 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRU-201ENST00000345512 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRU-201ENST00000345512 CEP131Q9UPN4 1083 aa17.94■□□□□ 0.46
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