RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.37■■□□□ 1.65
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PTDSS1-201ENST00000337004 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 SPC24Q8NBT2 197 aa25.37■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 KIAA1524Q8TCG1 905 aa25.37■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.37■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.36■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 LUZP1Q86V48 1076 aa25.36■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 TICAM2Q86XR7 235 aa25.36■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 CHGBP05060 677 aa25.36■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.36■■□□□ 1.65
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PTDSS1-201ENST00000337004 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.34■■□□□ 1.65
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PTDSS1-201ENST00000337004 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.34■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNF1Q9H3M0 494 aa25.34■■□□□ 1.65
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PTDSS1-201ENST00000337004 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.34■■□□□ 1.65
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PTDSS1-201ENST00000337004 PYCARDQ9ULZ3 195 aa25.31■■□□□ 1.64
PTDSS1-201ENST00000337004 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PTDSS1-201ENST00000337004 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.31■■□□□ 1.64
PTDSS1-201ENST00000337004 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PTDSS1-201ENST00000337004 ALS2Q96Q42 1657 aa25.3■■□□□ 1.64
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF165P49910 485 aa25.3■■□□□ 1.64
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PTDSS1-201ENST00000337004 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.29■■□□□ 1.64
PTDSS1-201ENST00000337004 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.29■■□□□ 1.64
PTDSS1-201ENST00000337004 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.29■■□□□ 1.64
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM5Q9C035 493 aa25.29■■□□□ 1.64
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PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.26■■□□□ 1.63
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PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.25■■□□□ 1.63
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PTDSS1-201ENST00000337004 CTDNEP1O95476 244 aa25.25■■□□□ 1.63
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PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM94Q12767 1356 aa25.24■■□□□ 1.63
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PTDSS1-201ENST00000337004 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTDSS1-201ENST00000337004 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PTDSS1-201ENST00000337004 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A1B0GUL7 405 aa25.22■■□□□ 1.63
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PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.22■■□□□ 1.63
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