RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 NYXQ9GZU5 481 aa23.2■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 RAD50Q92878 1312 aa23.19■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.19■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.19■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 HSPA4P34932 840 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 LRP5O75197 1615 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 ADRA2BP18089 450 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 PALD1Q9ULE6 856 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 RXRBP28702 533 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 SNRKQ9NRH2 765 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 A0A0D9SFI3 127 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 GOLIM4O00461 696 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 IL17RAQ96F46 866 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 C4AP0C0L4 1744 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 ST18O60284 1047 aa23.14■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 PTH1RQ03431 593 aa23.14■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
UPP1-201ENST00000331803 ABCC12Q96J65 1359 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 TICAM2Q86XR7 235 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 PROM2Q8N271 834 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 TXNRD1Q16881 649 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 LPIN2Q92539 896 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.12■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 FGFR2P21802 821 aa23.12■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 MED23Q9ULK4 1368 aa23.12■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 SSFA2P28290 1259 aa23.12■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 NLRP3Q96P20 1036 aa23.12■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 NEK4P51957 841 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 TAF5LO75529 589 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 SCARF1Q14162 830 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 NFIXQ14938 502 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 MAP4K1Q92918 833 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 SPEF2Q9C093 1822 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 PLSCR1O15162 318 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 CHGBP05060 677 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 SLC5A1P13866 664 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 APBA3O96018 575 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 CHRNDQ07001 517 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 CCDC102BQ68D86 513 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-201ENST00000331803 NPHP1O15259 732 aa23.08■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 ZAP70P43403 619 aa23.08■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 NECTIN1Q15223 517 aa23.08■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 RASEFQ8IZ41 740 aa23.08■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 GYS1P13807 737 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 MCAMP43121 646 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 COL4A1P02462 1669 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 SNAP23O00161 211 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 KCNJ4P48050 445 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 KCNB2Q92953 911 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 PHKA1P46020 1223 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 NBR1Q14596 966 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 PI16Q6UXB8 463 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 IL27Q8NEV9 243 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 CASZ1Q86V15 1759 aa23.06■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.05■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.05■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
UPP1-201ENST00000331803 MCM2P49736 904 aa23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.4 ms