RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

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Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 SLFNL1Q499Z3 407 aa27.35■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 GAS2L3Q86XJ1 694 aa27.35■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.35■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 ITGA6P23229 1130 aa27.34■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 RPS6KB1P23443 525 aa27.34■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 MRE11P49959 708 aa27.34■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 XAGE2Q96GT9 111 aa27.34■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.34■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 NCLP19338 710 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 TICAM2Q86XR7 235 aa27.34■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 TPCN1Q9ULQ1 816 aa27.34■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 ST3GAL1Q11201 340 aa27.33■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 HELLSQ9NRZ9 838 aa27.33■■□□□ 1.97
SNX18-201ENST00000326277 SLIT2O94813 1529 aa27.33■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 ATP6V1AP38606 617 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 GPT2Q8TD30 523 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 TCEANC2Q96MN5 208 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 GRPEL1Q9HAV7 217 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 SPEF2Q9C093 1822 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 GORABQ5T7V8 394 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 BARGINQ6ZT62 677 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.32■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.31■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 KRT32Q14532 448 aa27.31■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.31■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.31■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 MYH3P11055 1940 aa27.31■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.31■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.31■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 SYT1P21579 422 aa27.31■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 SIK1P57059 783 aa27.31■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.3■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 NECAB1Q8N987 351 aa27.3■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 PANK2Q9BZ23 570 aa27.3■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 STX6O43752 255 aa27.29■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 PDE8AO60658 829 aa27.29■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 TOM1O60784 492 aa27.29■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 CYP21A2P08686 494 aa27.29■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 GJB2P29033 226 aa27.29■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD1Q15327 319 aa27.29■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 METTL24Q5JXM2 366 aa27.29■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 DTNBO60941 627 aa27.28■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 ITPK1Q13572 414 aa27.28■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 ATP2B3Q16720 1220 aa27.28■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 NEK1Q96PY6 1258 aa27.28■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.28■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 SCARF1Q14162 830 aa27.27■■□□□ 1.96
SNX18-201ENST00000326277 MAST3O60307 1309 aa27.26■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 DSCC1Q9BVC3 393 aa27.26■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa27.26■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 SUSD4Q5VX71 490 aa27.25■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 VGLL2Q8N8G2 317 aa27.25■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 RREB1Q92766 1687 aa27.24■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 KCNQ2O43526 872 aa27.24■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 M0R2C6 588 aa27.23■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 ZNF445P59923 1031 aa27.23■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 CAMTA2O94983 1202 aa27.23■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 ZAP70P43403 619 aa27.23■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 STOX1Q6ZVD7 989 aa27.23■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 OSBP2Q969R2 916 aa27.23■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 GDPD2Q9HCC8 539 aa27.23■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 MBD3O95983 291 aa27.22■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 F13A1P00488 732 aa27.22■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 PI16Q6UXB8 463 aa27.22■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 ABCC12Q96J65 1359 aa27.22■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 AK7Q96M32 723 aa27.21■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 MTMR6Q9Y217 621 aa27.21■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 FAM177BA6PVY3 158 aa27.21■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 PDE8BO95263 885 aa27.2■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 TMEM63CQ9P1W3 806 aa27.2■■□□□ 1.95
SNX18-201ENST00000326277 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 Q6ZUG5 572 aa27.2■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 USP48Q86UV5 1035 aa27.2■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
SNX18-201ENST00000326277 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
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