RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CCDC71-201ENST00000321895 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.14■■□□□ 1.45
CCDC71-201ENST00000321895 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CCDC71-201ENST00000321895 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.14■■□□□ 1.45
CCDC71-201ENST00000321895 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
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CCDC71-201ENST00000321895 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.13■■□□□ 1.45
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CCDC71-201ENST00000321895 A0A1B0GUL6 1792 aa24.12■■□□□ 1.45
CCDC71-201ENST00000321895 ERC2O15083 957 aa24.12■■□□□ 1.45
CCDC71-201ENST00000321895 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.12■■□□□ 1.45
CCDC71-201ENST00000321895 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CCDC71-201ENST00000321895 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
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CCDC71-201ENST00000321895 C8orf34Q49A92 452 aa24.11■■□□□ 1.45
CCDC71-201ENST00000321895 A0A1B0GUL7 405 aa24.11■■□□□ 1.45
CCDC71-201ENST00000321895 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
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CCDC71-201ENST00000321895 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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CCDC71-201ENST00000321895 ATP2B3Q16720 1220 aa24.09■■□□□ 1.45
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CCDC71-201ENST00000321895 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.09■■□□□ 1.45
CCDC71-201ENST00000321895 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.09■■□□□ 1.45
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CCDC71-201ENST00000321895 SDSP20132 328 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 ATP5JP18859 108 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 FGFR2P21802 821 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
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CCDC71-201ENST00000321895 XAGE2Q96GT9 111 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 SRGNP10124 158 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 NPR1P16066 1061 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 TAF5LO75529 589 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 SLC5A1P13866 664 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 CDC45O75419 566 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 BBOX1O75936 387 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 ADORA1P30542 326 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 GORABQ5T7V8 394 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 MTFR1LQ9H019 292 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.02■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.02■■□□□ 1.44
CCDC71-201ENST00000321895 TMC4Q7Z404 712 aa24.02■■□□□ 1.44
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CCDC71-201ENST00000321895 ZBTB7AO95365 584 aa24■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 RILPL2Q969X0 211 aa24■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 BOLA2Q9H3K6 86 aa24■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 ALDH1B1P30837 517 aa23.99■■□□□ 1.43
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CCDC71-201ENST00000321895 H0YIN7 160 aa23.98■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.98■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.98■■□□□ 1.43
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CCDC71-201ENST00000321895 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.98■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 HAUS7Q99871 368 aa23.98■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 STYK1Q6J9G0 422 aa23.98■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 EVI5LQ96CN4 794 aa23.98■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 SNAP23O00161 211 aa23.97■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 POLD1P28340 1107 aa23.97■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 CASC1Q6TDU7 716 aa23.97■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 XDHP47989 1333 aa23.96■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.96■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 KCNJ4P48050 445 aa23.96■■□□□ 1.43
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC102BQ68D86 513 aa23.96■■□□□ 1.43
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CCDC71-201ENST00000321895 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
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CCDC71-201ENST00000321895 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CCDC71-201ENST00000321895 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa23.94■■□□□ 1.42
CCDC71-201ENST00000321895 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CCDC71-201ENST00000321895 SP8Q8IXZ3 490 aa23.94■■□□□ 1.42
CCDC71-201ENST00000321895 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.94■■□□□ 1.42
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.94■■□□□ 1.42
CCDC71-201ENST00000321895 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CCDC71-201ENST00000321895 PHKA1P46020 1223 aa23.93■■□□□ 1.42
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
CCDC71-201ENST00000321895 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
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