RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.41■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.41■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.41■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A0D9SFI3 127 aa26.4■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE8BO95263 885 aa26.4■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.4■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAG1Q9NWQ8 432 aa26.4■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.39■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.39■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.39■■□□□ 1.82
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADORA1P30542 326 aa26.38■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NYXQ9GZU5 481 aa26.38■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADRA2BP18089 450 aa26.38■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERFEQ4G0M1 354 aa26.38■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMIM5Q71RC9 77 aa26.38■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.38■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.38■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDIT3P35638 169 aa26.37■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTH1RQ03431 593 aa26.37■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GORABQ5T7V8 394 aa26.37■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNB2Q92953 911 aa26.37■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.37■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC39AQ5SRH9 613 aa26.36■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SETDB2Q96T68 719 aa26.36■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLIM4O00461 696 aa26.35■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCM2P49736 904 aa26.35■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.35■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP4K1Q92918 833 aa26.35■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.35■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.35■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EP400Q96L91 3159 aa26.35■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.35■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.35■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1B0GUL6 1792 aa26.35■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGFR2P21802 821 aa26.34■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEK4P51957 841 aa26.34■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.34■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYH7P12883 1935 aa26.33■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RFC4P35249 363 aa26.33■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NECTIN1Q15223 517 aa26.33■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.33■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LPIN2Q92539 896 aa26.33■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM37O94972 964 aa26.33■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.31■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL4A1P02462 1669 aa26.31■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASEFQ8IZ41 740 aa26.3■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.3■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAF5LO75529 589 aa26.3■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFKBIBQ15653 356 aa26.3■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.3■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.29■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.28■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHF14O94880 888 aa26.28■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCARF1Q14162 830 aa26.28■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.28■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.28■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC5A1P13866 664 aa26.28■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SSFA2P28290 1259 aa26.28■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAF1P21675 1872 aa26.27■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa26.27■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.27■■□□□ 1.8
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MCAMP43121 646 aa26.26■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC102BQ68D86 513 aa26.26■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.26■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLRP3Q96P20 1036 aa26.26■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZAP70P43403 619 aa26.25■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNJ4P48050 445 aa26.25■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF20Q5VTR2 975 aa26.25■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMG20BQ9P0W2 317 aa26.25■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHGBP05060 677 aa26.25■■□□□ 1.79
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHRNDQ07001 517 aa26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms