RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.87■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 ITGB4P16144 1822 aa22.87■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.87■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.87■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.87■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 PDCP20941 246 aa22.86■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 Q6ZUG5 572 aa22.86■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 FAM89AQ96GI7 184 aa22.86■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.85■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.85■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.85■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 LAMA4Q16363 1823 aa22.85■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 STARD3NLO95772 234 aa22.84■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 FERMT3Q86UX7 667 aa22.84■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.84■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.84■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 SPEF2Q9C093 1822 aa22.84■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 GTF3C6Q969F1 213 aa22.83■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.83■■□□□ 1.25
USP21-201ENST00000289865 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.83■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.83■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.82■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 ADORA1P30542 326 aa22.82■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 TICAM2Q86XR7 235 aa22.82■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 MAST3O60307 1309 aa22.82■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.82■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 JAK2O60674 1132 aa22.81■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 KRT85P78386 507 aa22.81■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.81■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 GORABQ5T7V8 394 aa22.81■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 FBXO3Q9UK99 471 aa22.81■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.81■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 FGD1P98174 961 aa22.8■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 HLFQ16534 295 aa22.8■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 HS1BP3Q53T59 392 aa22.8■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.8■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.8■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 BRF1Q92994 677 aa22.8■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 XAGE2Q96GT9 111 aa22.8■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 GPTP24298 496 aa22.8■■□□□ 1.24
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USP21-201ENST00000289865 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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USP21-201ENST00000289865 A0A0G2JLW4 131 aa22.78■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 BCL9O00512 1426 aa22.78■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.77■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 NLRP10Q86W26 655 aa22.77■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.77■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 OSBP2Q969R2 916 aa22.77■■□□□ 1.24
USP21-201ENST00000289865 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 SCRN1Q12765 414 aa22.76■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.76■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 LRP6O75581 1613 aa22.76■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 E7EWF7 191 aa22.76■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 SCARF1Q14162 830 aa22.76■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 DDX11Q96FC9 970 aa22.76■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.75■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.75■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.75■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.75■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 ELP1O95163 1332 aa22.75■■□□□ 1.23
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USP21-201ENST00000289865 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 APOBRQ0VD83 1088 aa22.74■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.74■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 GREM2Q9H772 168 aa22.74■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 MYH3P11055 1940 aa22.74■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 ITGA6P23229 1130 aa22.74■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 WASHC4Q2M389 1173 aa22.74■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 METTL24Q5JXM2 366 aa22.74■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 ZAP70P43403 619 aa22.73■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 UVSSAQ2YD98 709 aa22.73■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.73■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.73■■□□□ 1.23
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