RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa33.1■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZUG5 572 aa33.1■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 PRIMPOLQ96LW4 560 aa33.1■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 TNMDQ9H2S6 317 aa33.1■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 CABP4P57796 275 aa33.09■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 TYRO3Q06418 890 aa33.09■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa33.09■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 CYP21A2P08686 494 aa33.09■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 CARD10Q9BWT7 1032 aa33.09■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 AP5Z1O43299 807 aa33.08■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 PLCB2Q00722 1185 aa33.08■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 GPR108Q9NPR9 543 aa33.08■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 DACT1Q9NYF0 836 aa33.08■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 MRVI1Q9Y6F6 885 aa33.08■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 MPNDQ8N594 471 aa33.08■■■□□ 2.89
UBP1-201ENST00000283628 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 RESTQ13127 1097 aa33.07■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 CLSTN2Q9H4D0 955 aa33.07■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 LMBR1LQ6UX01 489 aa33.06■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa33.06■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 HELLSQ9NRZ9 838 aa33.06■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa33.06■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa33.06■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 H7C1W4 665 aa33.06■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 MYRIPQ8NFW9 859 aa33.06■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 JAK2O60674 1132 aa33.05■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 FOXO4P98177 505 aa33.05■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 BRF1Q92994 677 aa33.05■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 CHMP3Q9Y3E7 222 aa33.05■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa33.05■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 LAMA4Q16363 1823 aa33.05■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 RBM10P98175 930 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 CAMK4Q16566 473 aa33.05■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa33.05■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 FAM13BQ9NYF5 915 aa33.05■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 NUP188Q5SRE5 1749 aa33.04■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 DSCC1Q9BVC3 393 aa33.04■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 CFAP45Q9UL16 551 aa33.04■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 H3BQV1 296 aa33.03■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 IFFO2Q5TF58 517 aa33.03■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 PFKFB2O60825 505 aa33.03■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 SPEF2Q9C093 1822 aa33.02■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 SHANK3Q9BYB0 1731 aa33.02■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
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UBP1-201ENST00000283628 PAG1Q9NWQ8 432 aa33.01■■■□□ 2.88
UBP1-201ENST00000283628 MYH15Q9Y2K3 1946 aa33.01■■■□□ 2.87
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UBP1-201ENST00000283628 KIAA1524Q8TCG1 905 aa33.01■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 TJP1Q07157 1748 aa33■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 IL15P40933 162 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 FGD1P98174 961 aa33■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 SCRN1Q12765 414 aa33■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 PGBD1Q96JS3 809 aa33■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 KIF3AQ9Y496 699 aa33■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 BICD2Q8TD16 824 aa33■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 UBR2Q8IWV8 1755 aa32.99■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 CAVIN2O95810 425 aa32.99■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 ANO6Q4KMQ2 910 aa32.99■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 CKAP2LQ8IYA6 745 aa32.99■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 CHGBP05060 677 aa32.98■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 STOX1Q6ZVD7 989 aa32.98■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 AGXT2Q9BYV1 514 aa32.98■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 KCNF1Q9H3M0 494 aa32.98■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa32.98■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 CBX8Q9HC52 389 aa32.98■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 NR1I2O75469 434 aa32.97■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP32.97■■■□□ 2.872e-8■■■■□ 22
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UBP1-201ENST00000283628 GOLIM4O00461 696 aa32.97■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 NBPF14Q5TI25 921 aa32.97■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
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UBP1-201ENST00000283628 NBPF15Q8N660 670 aa32.97■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 CHMP4CQ96CF2 233 aa32.97■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 NEUROD6Q96NK8 337 aa32.97■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 ATG3Q9NT62 314 aa32.97■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 ERVV-2B6SEH9 535 aa32.96■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 EVA1CP58658 441 aa32.96■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa32.96■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
UBP1-201ENST00000283628 DDX11Q96FC9 970 aa32.95■■■□□ 2.87
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