RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261556.10

TMEM260-201, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TMEM260, Length 4,264 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-201ENST00000261556 CEP89Q96ST8 783 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 HYPKQ9NX55 129 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 PDCP20941 246 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 RANBP1P43487 201 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ATP10BO94823 1461 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 PTPRKQ15262 1439 aa14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 IRF6O14896 467 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 IQCA1Q86XH1 822 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 NECAB1Q8N987 351 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 KIF5CO60282 957 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 STX1AQ16623 288 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 KIF2CQ99661 725 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ELP1O95163 1332 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ARMC3Q5W041 872 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 AACSQ86V21 672 aa14.85□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 A0A087WWV3 80 aa14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 STARD3NLO95772 234 aa14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ODF2Q5BJF6 829 aa14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 SPDL1Q96EA4 605 aa14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.84□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 PPFIA4O75335 1185 aa14.83□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 CHMP4BP1P59074 171 aa14.83□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 MAP9Q49MG5 647 aa14.83□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 NGLY1Q96IV0 654 aa14.83□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 ACEP12821 1306 aa14.83□□□□□ -0.03
TMEM260-201ENST00000261556 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 F6X3S4 739 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 CHRNA2Q15822 529 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 POTEB2H3BUK9 544 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 HIP1O00291 1037 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 PPFIA3O75145 1194 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 CORO7P57737 925 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 SH3GL3Q99963 347 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.83□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.82□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 TEX11Q8IYF3 940 aa14.82□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.82□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.82□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.82□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 OLFM4Q6UX06 510 aa14.82□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 ASXL2Q76L83 1435 aa14.82□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.81□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.81□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 AP1G2O75843 785 aa14.81□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 CTAGE8P0CG41 777 aa14.81□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.81□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.81□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.81□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 CD248Q9HCU0 757 aa14.81□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 PTPRCP08575 1304 aa14.81□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.81□□□□□ -0.04
TMEM260-201ENST00000261556 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.5 ms