RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 EVA1CP58658 441 aa22.83■■□□□ 1.24
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LPCAT3-201ENST00000261407 SYNE4Q8N205 404 aa22.83■■□□□ 1.24
LPCAT3-201ENST00000261407 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.82■■□□□ 1.24
LPCAT3-201ENST00000261407 LIG1P18858 919 aa22.82■■□□□ 1.24
LPCAT3-201ENST00000261407 KRT85P78386 507 aa22.82■■□□□ 1.24
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM89AQ96GI7 184 aa22.82■■□□□ 1.24
LPCAT3-201ENST00000261407 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.82■■□□□ 1.24
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
LPCAT3-201ENST00000261407 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.8■■□□□ 1.24
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LPCAT3-201ENST00000261407 PALLDQ8WX93 1383 aa22.79■■□□□ 1.24
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LPCAT3-201ENST00000261407 M0R2C6 588 aa22.79■■□□□ 1.24
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LPCAT3-201ENST00000261407 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.78■■□□□ 1.24
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LPCAT3-201ENST00000261407 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.78■■□□□ 1.24
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LPCAT3-201ENST00000261407 PLCB2Q00722 1185 aa22.77■■□□□ 1.24
LPCAT3-201ENST00000261407 SCARF1Q14162 830 aa22.77■■□□□ 1.24
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.77■■□□□ 1.24
LPCAT3-201ENST00000261407 OSBP2Q969R2 916 aa22.77■■□□□ 1.24
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LPCAT3-201ENST00000261407 SPATA32Q96LK8 384 aa22.77■■□□□ 1.23
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LPCAT3-201ENST00000261407 CTDNEP1O95476 244 aa22.75■■□□□ 1.23
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LPCAT3-201ENST00000261407 XAGE2Q96GT9 111 aa22.75■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 PAPPAQ13219 1627 aa22.75■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 GPTP24298 496 aa22.75■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 HLFQ16534 295 aa22.75■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.75■■□□□ 1.23
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LPCAT3-201ENST00000261407 PGBD1Q96JS3 809 aa22.74■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 DACT1Q9NYF0 836 aa22.74■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.74■■□□□ 1.23
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LPCAT3-201ENST00000261407 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.71■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.71■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.71■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 NR1I2O75469 434 aa22.71■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.71■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 BTG4Q9NY30 223 aa22.71■■□□□ 1.23
LPCAT3-201ENST00000261407 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.7■■□□□ 1.22
LPCAT3-201ENST00000261407 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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