RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 RLBP1P12271 317 aa18.23■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 DESP17661 470 aa18.23■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 CCDC42Q96M95 316 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 NAPBQ9H115 298 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA6BA6NDN3 693 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 CABS1Q96KC9 395 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 BRD3Q15059 726 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 TLDC2A0PJX2 215 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 FAM160A1Q05DH4 1040 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 PRXQ9BXM0 1461 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 GBP1P32455 592 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 TNNC1P63316 161 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 CLSTN2Q9H4D0 955 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 NLRP5P59047 1200 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 CEP85LQ5SZL2 805 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 VCXQ9H320 206 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 TNNQ9UQP3 1299 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 BTBD11A6QL63 1104 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 KIF3CO14782 793 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 ATP2B2Q01814 1243 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 PPFIA1Q13136 1202 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CTIF-201ENST00000256413 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 CFAP57Q96MR6 1250 aa18.21■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 VIMP08670 466 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 UBA7P41226 1012 aa18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 CCDC122Q5T0U0 273 aa18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 AKAP2Q9Y2D5 859 aa18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 STMN2Q93045 179 aa18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 IKBKGQ9Y6K9 419 aa18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD24Q8TF21 1146 aa18.2■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 SMIM23A6NLE4 172 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 IDEP14735 1019 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 FLIIQ13045 1269 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 RHPN1Q8TCX5 695 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 LIG3P49916 1009 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 MICU3Q86XE3 530 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 ELP1O95163 1332 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 CTNNA2P26232 953 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 TCERG1LQ5VWI1 586 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 ABTB2Q8N961 1025 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 CALML4Q96GE6 196 aa18.19■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZUG5 572 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 ARHGAP6O43182 974 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 ALG1Q9BT22 464 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 PLVAPQ9BX97 442 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 PRDM2Q13029 1718 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 NCOA7Q8NI08 942 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 EXOC1Q9NV70 894 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 BMP15O95972 392 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 CCDC38Q502W7 563 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.18■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 A0A087WZG4 1122 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 TSGA10Q9BZW7 698 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 DCTPP1Q9H773 170 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 MBIPQ9NS73 344 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 PSMA7O14818 248 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 UBXN1Q04323 297 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 SPAG5Q96R06 1193 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 ATL3Q6DD88 541 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 MEIS3Q99687 375 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa18.17■□□□□ 0.5
CTIF-201ENST00000256413 PARD3Q8TEW0 1356 aa18.17■□□□□ 0.5
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