RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 TXNRD1Q16881 649 aa25.63■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.63■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 ATP2B3Q16720 1220 aa25.62■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 LRP5O75197 1615 aa25.61■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 CHGBP05060 677 aa25.61■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 IL27Q8NEV9 243 aa25.61■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.61■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 GORABQ5T7V8 394 aa25.6■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.6■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 PALD1Q9ULE6 856 aa25.6■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.6■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 PDE8BO95263 885 aa25.59■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 POTEAQ6S8J7 498 aa25.59■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 A0A0D9SFI3 127 aa25.59■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.59■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 SNAP23O00161 211 aa25.58■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 GOLIM4O00461 696 aa25.58■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 APBA3O96018 575 aa25.58■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 HSCBQ8IWL3 235 aa25.58■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 RTL9Q8NET4 1388 aa25.58■■□□□ 1.69
RFXAP-201ENST00000255476 TAF5LO75529 589 aa25.58■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 NYXQ9GZU5 481 aa25.58■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 NFIXQ14938 502 aa25.57■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.57■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.57■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 SNRKQ9NRH2 765 aa25.57■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.57■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 ADRA2BP18089 450 aa25.57■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.57■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 SNX21Q969T3 373 aa25.57■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.56■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 SCARF1Q14162 830 aa25.56■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 RABEP1Q15276 862 aa25.56■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.56■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.56■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 RAD50Q92878 1312 aa25.56■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 HIP1O00291 1037 aa25.55■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 PTH1RQ03431 593 aa25.55■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.55■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 MCCP23508 829 aa25.54■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.54■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 PI16Q6UXB8 463 aa25.54■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.54■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 GYS1P13807 737 aa25.53■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 NPHP1O15259 732 aa25.53■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 SSFA2P28290 1259 aa25.53■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 HSPA4P34932 840 aa25.53■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 PLSCR1O15162 318 aa25.52■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 FGFR2P21802 821 aa25.52■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.52■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 NLRP3Q96P20 1036 aa25.52■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
RFXAP-201ENST00000255476 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.51■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 CHRNDQ07001 517 aa25.51■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF827Q17R98 1081 aa25.51■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.51■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.51■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 FBXO41Q8TF61 875 aa25.51■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 LPIN2Q92539 896 aa25.51■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 PHKA1P46020 1223 aa25.5■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.5■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 MCAMP43121 646 aa25.49■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 ZAP70P43403 619 aa25.49■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 MED23Q9ULK4 1368 aa25.49■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC102BQ68D86 513 aa25.49■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.49■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.48■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 RASEFQ8IZ41 740 aa25.48■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 ANAPC15P60006 121 aa25.48■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 CNBD1Q8NA66 436 aa25.47■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.47■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.47■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 SLC5A1P13866 664 aa25.47■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 NEK4P51957 841 aa25.47■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.47■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 A0A1B0GUL6 1792 aa25.45■■□□□ 1.67
RFXAP-201ENST00000255476 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms