RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236192.11

VAMP4-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP4, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-201ENST00000236192 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.65□□□□□ -0.06
VAMP4-201ENST00000236192 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VAMP4-201ENST00000236192 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 TCHPQ9BT92 498 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 GGNBP2Q9H3C7 697 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 ATP2B2Q01814 1243 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.64□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 E7EVH7 732 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 VPS53Q5VIR6 699 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 TRAF1Q13077 416 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF365Q70YC5 407 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 SPG7Q9UQ90 795 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 PSMD2Q13200 908 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 SLMAPQ14BN4 828 aa14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 FCHSD2O94868 740 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 RWDD2BP57060 319 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 DDIT3P35638 169 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 MYL5Q02045 173 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 SPATA24Q86W54 205 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 TSC22D3Q99576 134 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 PTPRCP08575 1304 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 FBXO3Q9UK99 471 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 NSD3Q9BZ95 1437 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 SPDL1Q96EA4 605 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 HECW1Q76N89 1606 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC102BQ68D86 513 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 SAMM50Q9Y512 469 aa14.62□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 RANBP1P43487 201 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 FAM210AQ96ND0 272 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 GOPCQ9HD26 462 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 SEPT6Q14141 434 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 ATL3Q6DD88 541 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 KLHL10Q6JEL2 608 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 NECTIN2Q92692 538 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 XBP1P17861 261 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 SYKP43405 635 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 PSME1Q06323 249 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CRYMQ14894 314 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 KRT86O43790 486 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CASP8Q14790 479 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 C8orf76Q96K31 380 aa14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 KRT83P78385 493 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 KIF14Q15058 1648 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CDKL5O76039 1030 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 PPP1R7Q15435 360 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 MLECQ14165 292 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 TRIM7Q9C029 511 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 MYO1BO43795 1136 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 GUCY1B3Q02153 619 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.6□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 PFDN1O60925 122 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CHMLP26374 656 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 MMP14P50281 582 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 NFE2L2Q16236 605 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 BATF3Q9NR55 127 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 CREB3O43889 395 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 SCP2P22307 547 aa14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
VAMP4-201ENST00000236192 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms