RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224949.8

PITRM1-201, Transcript of pitrilysin metallopeptidase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITRM1, Length 3,450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-201ENST00000224949 ERO1AQ96HE7 468 aa14.78□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.78□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 TMX1Q9H3N1 280 aa14.78□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.78□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 NEMFO60524 1076 aa14.78□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 CCZ1BP86790 482 aa14.78□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 KRT32Q14532 448 aa14.78□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 IFNKQ9P0W0 207 aa14.78□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 CYP21A2P08686 494 aa14.77□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.77□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.77□□□□□ -0.04
PITRM1-201ENST00000224949 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.77□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 CCDC66A2RUB6 948 aa14.76□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 ALDH1L1O75891 902 aa14.76□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 CTAGE5O15320 804 aa14.76□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 NRDCO43847 1150 aa14.76□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 CAVIN2O95810 425 aa14.76□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 CDC25BP30305 580 aa14.76□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 MTX1Q13505 466 aa14.76□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 MYD88Q99836 296 aa14.76□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 STK38Q15208 465 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 EID1Q9Y6B2 187 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 TFCP2Q12800 502 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 SLC39A6Q13433 755 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 KAZALD1Q96I82 304 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 DNAI1Q9UI46 699 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 LINS1Q8NG48 757 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.75□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.74□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.74□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.74□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 SARM1Q6SZW1 724 aa14.74□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 MNS1Q8NEH6 495 aa14.74□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.74□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 A0A0G2JLW4 131 aa14.74□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.74□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 TAF3Q5VWG9 929 aa14.74□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 TNRQ92752 1358 aa14.73□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 URI1O94763 535 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 GOLGA8FQ08AF8 430 aa14.73□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa14.73□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 KLHL34Q8N239 644 aa14.73□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 GSDMDP57764 484 aa14.73□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.73□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 GOLIM4O00461 696 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 TECPR2O15040 1411 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 MED23Q9ULK4 1368 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 NDUFA8P51970 172 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 UBXN4Q92575 508 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 HAND2P61296 217 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 TPM4P67936 248 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.72□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 COL15A1P39059 1388 aa14.71□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 TSPOAP1O95153 1857 aa14.71□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 HOXB7P09629 217 aa14.71□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 CLCN6P51797 869 aa14.71□□□□□ -0.05
PITRM1-201ENST00000224949 TIGD1Q96MW7 591 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms