RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000203435.2

Lmo3-208, Transcript of LIM domain only protein 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Lmo3, Length 572 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Glis3Q6XP49 780 aa9.33□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Slc14a2Q8R4T9 930 aa9.33□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 PdgfdQ925I7 370 aa9.33□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Sh3bp5Q9Z131 463 aa9.33□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Rbbp6P97868 1790 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa9.32□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Bin2D3Z6Q9 489 aa9.32□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 AaasP58742 546 aa9.32□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Map9Q3TRR0 646 aa9.32□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Ccdc93Q7TQK5 629 aa9.32□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Tmem132aQ922P8 1018 aa9.32□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Usp34Q6ZQ93 3582 aa9.32□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Cfap44E9Q5M6 1843 aa9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Psme4Q5SSW2 1843 aa9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Ankrd44B2RXR6 993 aa9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Eif6O55135 245 aa9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Ftl2P49945 183 aa9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Ell2Q3UKU1 639 aa9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 CbarpQ66L44 698 aa9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Pank1Q8K4K6 548 aa9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Tmem143Q8VD26 458 aa9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Osbpl5Q9ER64 874 aa9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Kcnq5Q9JK45 933 aa9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Stk36Q69ZM6 1316 aa9.31□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Mical3Q8CJ19 1993 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Slc4a9E9PUP3 929 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 UncxO08934 530 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 GabrdP22933 449 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 SobpQ0P5V2 864 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 VgfQ0VGU4 617 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Plekhf1Q3TB82 279 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Tom1l2Q5SRX1 507 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Dhx38Q80X98 1228 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Tceal9Q9DD24 104 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 MvpQ9EQK5 861 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 LratQ9JI60 231 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Plekho1Q9JIY0 408 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 NinQ61043 2035 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Trpm7Q923J1 1863 aa9.3□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Peak1Q69Z38 1735 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 ArxO35085 564 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Psmd14O35593 310 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Casp1P29452 402 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Prkar2bP31324 416 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Rbm46P86049 533 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 GmpsQ3THK7 693 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Ccdc51Q3URS9 406 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 DaglaQ6WQJ1 1044 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Ptrh1Q8BW00 204 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Chmp3Q9CQ10 224 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Klf15Q9EPW2 415 aa9.29□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Ier5O89113 308 aa9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Sult6b1P0CC03 303 aa9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Rhbdl3P58873 404 aa9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Csrnp1P59054 583 aa9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Gja3Q64448 417 aa9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Atg9aQ68FE2 551 aa9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Scaf8Q6DID3 1268 aa9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Aldh1l2Q8K009 923 aa9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Sytl4Q9R0Q1 673 aa9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 NrapQ80XB4 1728 aa9.28□□□□□ -0.92
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Brpf1B2RRD7 1212 aa9.27□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Eya2O08575 532 aa9.27□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Terf1P70371 421 aa9.27□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Plbd2Q3TCN2 594 aa9.27□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa9.27□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Trim58Q5NCC9 485 aa9.27□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Tmem87bQ8BKU8 555 aa9.27□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Tmem67Q8BR76 992 aa9.27□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Zkscan8Q8BSL0 588 aa9.27□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Plcd4Q8K3R3 807 aa9.27□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Rwdd1Q9CQK7 243 aa9.27□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Triml2E9PW10 424 aa9.26□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Pde8bE9Q4S1 865 aa9.26□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Usp17lbE9Q9U0 468 aa9.26□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 AppP12023 770 aa9.26□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Ets1P27577 440 aa9.26□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Gm2163Q6PCY5 473 aa9.26□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Q8C5K5 320 aa9.26□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Ciao1Q99KN2 339 aa9.26□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Lmo3-208ENSMUST00000203435 Tnip1Q9WUU8 647 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.7 ms