RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	ABHD16A	O95870	558 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	IGKV3-11	P04433	115 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	GUSB	P08236	651 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	GP1BB	P13224	206 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TAS2R20	P59543	309 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	LINC00303	Q3SY05	128 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	WDR38	Q5JTN6	314 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	HACD4	Q5VWC8	232 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CDH26	Q8IXH8	852 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ST8SIA4	Q92187	359 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		11.65	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	METTL12	A8MUP2	240 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	GABARAP	H6UMI1	98 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SUSD5	O60279	629 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF217	O75362	1048 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	WNT11	O96014	354 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	OPN1LW	P04000	364 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	HLA-DOB	P13765	273 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	IL11	P20809	199 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55	8e-6	■■□□□ 11.9
SMTN-222	ENST00000612341	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CFHR1	Q03591	330 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ISX	Q2M1V0	245 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	OR8S1	Q8NH09	359 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SGK3	Q96BR1	496 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	NOX3	Q9HBY0	568 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	EMC7	Q9NPA0	242 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	MUC3A	Q02505	3323 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	LMO7DN	F2Z398	122 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SULT1B1	O43704	296 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	KDM4B	O94953	1096 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ZP1	P60852	638 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ADAM8	P78325	824 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	HSD11B2	P80365	405 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	DYRK1A	Q13627	763 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	GPR148	Q8TDV2	347 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	LAT2	Q9GZY6	243 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	VDAC3	Q9Y277	283 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	RTTN	Q86VV8	2226 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	C10orf142	B7Z368	130 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CTLA4	P16410	223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	MAP2K6	P52564	334 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ADAM19	Q9H013	955 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	DLL4	Q9NR61	685 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	PNP	P00491	289 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	RLN1	P04808	185 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	KIR3DL2	P43630	455 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	CBFB	Q13951	182 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	POU4F3	Q15319	338 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	KRT77	Q7Z794	578 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	MEIOB	Q8N635	442 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	HAVCR1	Q96D42	359 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341		F8W036	122 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	BGLAP	P02818	100 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ALDOB	P05062	364 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	PGC	P20142	388 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ANGPT1	Q15389	498 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	FTMT	Q8N4E7	242 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	PHYHIP	Q92561	330 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SMTN-222	ENST00000612341	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55

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