RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRAV39A0A0B4J263 110 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 SMIM30A4D0T7 59 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 A4D1N5 150 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF726A6NNF4 738 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR7C2O60412 319 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 UTS2O95399 124 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 PGCP20142 388 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 PAX7P23759 505 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 AK4P27144 223 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 HRH1P35367 487 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 RFX3P48380 749 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 GSSP48637 474 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCNG1P51959 295 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATP1B3P54709 279 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 STX1BP61266 288 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TNFRSF17Q02223 184 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TSC22D1Q15714 1073 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC25A52Q3SY17 297 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 KLHL12Q53G59 568 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 YIF1BQ5BJH7 314 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 PDZD11Q5EBL8 140 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CARD16Q5EG05 197 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 AVPI1Q5T686 147 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 PLET1Q6UQ28 207 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM179Q6ZVK1 233 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 UTS2BQ765I0 119 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM17Q86X19 198 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR2L13Q8N349 312 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 LSMEM1Q8N8F7 131 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 STEAP2Q8NFT2 490 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC26A10Q8NG04 563 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR5AU1Q8NGC0 362 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR11H7Q8NGC8 314 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR4D9Q8NGE8 314 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR5L2Q8NGL0 311 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 SDR42E1Q8WUS8 393 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR5P3Q8WZ94 311 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 NCLNQ969V3 563 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 VSTM2LQ96N03 204 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OXGR1Q96P68 337 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 GIN1Q9NXP7 522 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 CYP39A1Q9NYL5 469 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 AIPL1Q9NZN9 384 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR10H1Q9Y4A9 318 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 TECTAO75443 2155 aa-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 OTOFQ9HC10 1997 aa-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCDC182A6NF36 153 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 HIDE1A8MVS5 230 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 G3V3Q6 166 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 PSCAO43653 123 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CREB3O43889 395 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 AIFM1O95831 613 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGHMP01871 453 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 ACSM4P0C7M7 580 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 PKNOX1P55347 436 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 ERVK-25P63136 954 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 TYSND1Q2T9J0 566 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 LINC01620Q4KN68 170 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR52E8Q6IFG1 317 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF410Q86VK4 478 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 LINC00469Q8N7U9 141 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 LEMD2Q8NC56 503 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR4C13Q8NGP0 309 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC2A14Q8TDB8 520 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 DTD2Q96FN9 168 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 C12orf66Q96MD2 445 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 NPY6RQ99463 290 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 GGTLC1Q9BX51 225 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 METTL7AQ9H8H3 244 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM49BQ9NUQ9 324 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 HMGXB4Q9UGU5 601 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 FBXW2Q9UKT8 454 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 MMP17Q9ULZ9 603 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 DDX19BQ9UMR2 479 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF462Q96JM2 2506 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 NCKAP5O14513 1909 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 ABCA4P78363 2273 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 KDRP35968 1356 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa-0.67□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.8 ms