RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	HPGDS	O60760	199 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PRAF2	O60831	178 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJB6	O75190	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SC5D	O75845	299 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CD14	P08571	375 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CYC1	P08574	325 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ADRA2A	P08913	450 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	UCHL1	P09936	223 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CALCB	P10092	127 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PVR	P15151	417 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NAGA	P17050	411 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SRM	P19623	302 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PGC	P20142	388 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	AHCY	P23526	432 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CXCR1	P25024	350 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CD1C	P29017	333 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PYCR1	P32322	319 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RFX2	P48378	723 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MMP15	P51511	669 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	EFR3A	Q14156	821 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CRMP1	Q14194	572 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	BAK1	Q16611	211 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ARL9	Q6T311	187 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM234	Q8WY98	164 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC7A6	Q92536	515 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NSMAF	Q92636	917 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	GHSR	Q92847	366 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MED30	Q96HR3	178 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PRR25	Q96S07	402 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RERGL	Q9H628	205 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NANS	Q9NR45	359 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1B0GVI7	797 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	EPOP	A6NHQ4	379 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PTPRM-215	ENST00000583289	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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